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Properties
| Property Name | Value |
|---|
| TranscriptId | 450775 |
| Track | FilteredModels2 |
| ProteinId | 450689 |
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_93 | supercontig | scaffold_93:39509..40942 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >mRNA_11743 ID=mRNA_11743|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|450689|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=1181bp
AGAAAAGAGGGTCGTGCCCTTCCCCATGCCCGGTGTTGATGACATGTCGA
AGCTGCTCCTGCCACTTCCACCGGAACCACCAGCATAATGTCCACCACTG
CCATTGATTTTTTGGCAAATTCTCAAAACGTCATCGGCGTACTCAGATGT
GCACAGCCGCTCAATCGTCTCATCTGTCAACCCACCCAGGTCATCGTCGT
CCTCTTCCTCCACTCTTCCGCCCCGAGTCTCCAGTCTCCTCCTTCCCCTC
TATCCTTCCCATTCTTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTTCCTCCCTCTTTCCT
TTTCTCCCTTTCCTCCCTTCTTCCCTCGATCCTTCTCTTTGTTCTTTTGC
ACGCAATTCAACATCTTTGCTACAGAGAAGCCTTCATGCTCCTCCTCCTC
TCCTCCTTCTCCTCCTTCTCCCTGCCTTAAACTCCTTTTCTACGTCTTCC
TCCCTTTCCTCTCCTCTTTCTCCTCCTCCTCCCAGCCTCTTCTTTCTCTT
CCTTTTTCCTGCCTCTCTAATCCTCGCCTCCTTCCCATCCTCATCTCCTC
CTTCCTCTCCTCCCACCCCACCTCCTCCCTGCCTCTTGCTCCTTCTTCAG
CTTGTCCCTCCCCTCCCCGACGCCCTTCTCCTTCTCCTCCTTATCTTCCT
CTTCCACAATTACTTGCCCTTTCTTCTCCTACCCCTTCTCCTCCCTATCT
CCCTATTCCTCCATCCTCTTCCCCTCCTCCTTTCCTTCATTTCCCTCTTT
TTTCACATTTCCCTCCTGTCCTTCCTTTCCCTTCTCCTCCTTGGCTCCCT
CCTTTTCCTCTCCCCTTTTTCCTCCTCCTGCCCGCCTCCCTCTCTCTCCC
CCCTTTTCCATCCTCTTCTCTGCCTCTCTCCTTCTCGCCTCTTTCCCTTC
CCCTCCTTGGCTCCCTCCTCGTGTCTCTCGTCCTCGCCTCCTCCTCTTTC
GATAGAGGAGGACAGTCTCCATCTTTCCCTCGATCCTTCTCGTCCTTTCT
CCTCTTCTCCCTCTTTTCCTCTCTCTTACCCTTCTTTCCCCCTTTATCCC
TTCCTCCTTTGCACGCTCCTTCATTTCTTGCGATTGATTCCGTGACGTGA
CACCGAGTTTGGCCGGCCGATGAGCACCACCGATCGCATGTGCAGGAGAG
ATAGTTCCCTTTGTCTTCGCGTTTGAAGACA back to topprotein sequence of jgi.p|Nanoce1779_2|450689 >mRNA_11743-protein ID=mRNA_11743-protein|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|450689|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=336bp
MSTTAIDFLANSQNVIGVLRCAQPLNRLICQPTQVIVVLFLHSSAPSLQS
PPSPLSFPFFLLSSLFSSLFPFLPFLPSSLDPSLCSFARNSTSLLQRSLH
APPPLLLLLLLPALNSFSTSSSLSSPLSPPPPSLFFLFLFPASLILASFP
SSSPPSSPPTPPPPCLLLLLQLVPPLPDALLLLLLIFLFHNYLPFLLLPL
LLPISLFLHPLPLLLSFISLFFHISLLSFLSLLLLGSLLFLSPFSSSCPP
PSLSPLFHPLLCLSPSRLFPFPSLAPSSCLSSSPPPLSIEEDSLHLSLDP
SRPFSSSPSFPLSYPSFPLYPFLLCTLLHFLRLIP* back to topmRNA from alignment at scaffold_93:39509..40942- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_11743 ID=mRNA_11743|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|450689|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_93:39509..40942- (Nannochloropsis oceanica)
AGAAAAGAGGGTCGTGCCCTTCCCCATGCCCGGTGTTGATGACATGTCGA
AGCTGCTCCTGCCACTTCCACCGGAACCACCAGCATAATGTCCACCACTG
CCATTGATTTTTTGGCAAATTCTCAAAACGTCATCGGCGTACTCAGATGT
GCACAGCCGCTCAATCGTCTCATCTGTCAACCCACCCAGGTCATCGTCGT
CCTCTTCCTCCACTCTTCCGCCCCGAGTCTCCATCCTCCTCCCCCCTCTC
CTCTTCCTCCTCTCCTAATCGTCACTCCTCCTTGTCTCTTCCTCTTCCCC
TCCTCTTCCTCCTCATCTCTCTCCCGCGTCTACCTCCTCCCTCGTCCTTG
ACGCCTCCCCACTACCCTGCTCTTCCTCCTCGCCTCCTGCTTTTTCAATA
GAGGACAGTCTCCTCCTTCCCCTCTATCCTTCCCATTCTTCCTCCTCTCC
TCCCTCTTTTCCTCCCTCTTTCCTTTTCTCCCTTTCCTCCCTTCTTCCCT
CGATCCTTCTCTTTGTTCTTTTGCACGCAATTCAACATCTTTGCTACAGA
GAAGCCTTCATGCTCCTCCTCCTCTCCTCCTTCTCCTCCTTCTCCCTGCC
TTAAACTCCTTTTCTACGTCTTCCTCCCTTTCCTCTCCTCTTTCTCCTCC
TCCTCCCAGCCTCTTCTTTCTCTTCCTCCCCGTTTCCTTTCCTTTTCCCT
CTTCTTCTTCCTCCTCCTCCACATCTCCCTCGTTTTCCCCTCCTCTTCTC
CCTCCTTTTTCCTGCCTCTCTAATCCTCGCCTCCTTCCCATCCTCATCTC
CTCCTTCCTCTCCTCCCACCCCACCTCCTCCCTGCCTCTTGCTCCTTCTT
CAGCTTGTCCCTCCCCTCCCCGACGCCCTTCTCCTTCTCCTCCTTATCTT
CCTCTTCCACAATTACTTGCCCTTTCTTCTCCTACCCCTTCTCCTCCCTA
TCTCCCTATTCCTCCATCCTCTTCCCCTCCTCCTTTCCTTCATTTCCCTC
TTTTTTCACATTTCCCTCCTGTCCTTCCTTTCCCTTCTCCTCCTTGGCTC
CCTCCTTTTCCTCTCCCCTTTTTCCTCCTCCTGCCCGCCTCCCTCTCTCT
CCCCCCTTTTCCATCCTCTTCTCTGCCTCTCTCCTTCTCGCCTCTTTCCC
TTCCCCTCCTTGGCTCCCTCCTCGTGTCTCTCGTCCTCGCCTCCTCCTCT
TTCGATAGAGGAGGACAGTCTCCATCTTTCCCTCGATCCTTCTCGTCCTT
TCTCCTCTTCTCCCTCTTTTCCTCTCTCTTACCCTTCTTTCCCCCTTTAT
CCCTTCCTCCTTTGCACGCTCCTTCATTTCTTGCGATTGATTCCGTGACG
TGACACCGAGTTTGGCCGGCCGATGAGCACCACCGATCGCATGTGCAGGA
GAGATAGTTCCCTTTGTCTTCGCGTTTGAAGACA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold_93:39509..40942- >mRNA_11743 ID=mRNA_11743|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|450689|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=3024bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_93:39509..40942- (Nannochloropsis oceanica)
TCCTTTTTCCTGCCTCTCTAATCCTCGCCTCCTTCCCATCCTCATCTCCT
CCTTCCTCTCCTCCCACCCCACCTCCTCCCTGCCTCTTGCTCCTTCTTCA
GCTTGTCCCTCCCCTCCCCGACGCCCTTCTCCTTCTCCTCCTTATCTTCC
TCTTCCACAATTACTTGCCCTTTCTTCTCCTACCCCTTCTCCTCCCTATC
TCCCTATTCCTCCATCCTCTTCCCCTCCTCCTTTCCTTCATTTCCCTCTT
TTTTCACATTTCCCTCCTGTCCTTCCTTTCCCTTCTCCTCCTTGGCTCCC
TCCTTTTCCTCTCCCCTTTTTCCTCCTCCTGCCCGCCTCCCTCTCTCTCC
CCCCTTTTCCATCCTCTTCTCTGCCTCTCTCCTTCTCGCCTCTTTCCCTT
CCCCTCCTTGGCTCCCTCCTCGTGTCTCTCGTCCTCGCCTCCTCCTCTTT
CGATAGAGGAGGACAGTCTCCATCTTTCCCTCGATCCTTCTCGTCCTTTC
TCCTCTTCTCCCTCTTTTCCTCTCTCTTACCCTTCTTTCCCCCTTTATCC
CTTCCTCCTTTGCACGCTCCTTCATTTCTTGCGATTGATTCCGTGAAGTC
TCCTCCTTCCCCTCTATCCTTCCCATTCTTCCTCCTCTCCTCCCTCTTTT
CCTCCCTCTTTCCTTTTCTCCCTTTCCTCCCTTCTTCCCTCGATCCTTCT
CTTTGTTCTTTTGCACGCAATTCAACATCTTTGCTACAGAGAAGCCTTCA
TGCTCCTCCTCCTCTCCTCCTTCTCCTCCTTCTCCCTGCCTTAAACTCCT
TTTCTACGTCTTCCTCCCTTTCCTCTCCTCTTTCTCCTCCTCCTCCCAGC
CTCTTCTTTCTCTATGTCCACCACTGCCATTGATTTTTTGGCAAATTCTC
AAAACGTCATCGGCGTACTCAGATGTGCACAGCCGCTCAATCGTCTCATC
TGTCAACCCACCCAGGTCATCGTCGTCCTCTTCCTCCACTCTTCCGCCCC
GAGTCTCCTCCTTTTTCCTGCCTCTCTAATCCTCGCCTCCTTCCCATCCT
CATCTCCTCCTTCCTCTCCTCCCACCCCACCTCCTCCCTGCCTCTTGCTC
CTTCTTCAGCTTGTCCCTCCCCTCCCCGACGCCCTTCTCCTTCTCCTCCT
TATCTTCCTCTTCCACAATTACTTGCCCTTTCTTCTCCTACCCCTTCTCC
TCCCTATCTCCCTATTCCTCCATCCTCTTCCCCTCCTCCTTTCCTTCATT
TCCCTCTTTTTTCACATTTCCCTCCTGTCCTTCCTTTCCCTTCTCCTCCT
TGGCTCCCTCCTTTTCCTCTCCCCTTTTTCCTCCTCCTGCCCGCCTCCCT
CTCTCTCCCCCCTTTTCCATCCTCTTCTCTGCCTCTCTCCTTCTCGCCTC
TTTCCCTTCCCCTCCTTGGCTCCCTCCTCGTGTCTCTCGTCCTCGCCTCC
TCCTCTTTCGATAGAGGAGGACAGTCTCCATCTTTCCCTCGATCCTTCTC
GTCCTTTCTCCTCTTCTCCCTCTTTTCCTCTCTCTTACCCTTCTTTCCCC
CTTTATCCCTTCCTCCTTTGCACGCTCCTTCATTTCTTGCGATTGATTCC
GTGAAGTCTCCTCCTTCCCCTCTATCCTTCCCATTCTTCCTCCTCTCCTC
CCTCTTTTCCTCCCTCTTTCCTTTTCTCCCTTTCCTCCCTTCTTCCCTCG
ATCCTTCTCTTTGTTCTTTTGCACGCAATTCAACATCTTTGCTACAGAGA
AGCCTTCATGCTCCTCCTCCTCTCCTCCTTCTCCTCCTTCTCCCTGCCTT
AAACTCCTTTTCTACGTCTTCCTCCCTTTCCTCTCCTCTTTCTCCTCCTC
CTCCCAGCCTCTTCTTTCTCTATGTCCACCACTGCCATTGATTTTTTGGC
AAATTCTCAAAACGTCATCGGCGTACTCAGATGTGCACAGCCGCTCAATC
GTCTCATCTGTCAACCCACCCAGGTCATCGTCGTCCTCTTCCTCCACTCT
TCCGCCCCGAGTCTCCTCCTTTTTCCTGCCTCTCTAATCCTCGCCTCCTT
CCCATCCTCATCTCCTCCTTCCTCTCCTCCCACCCCACCTCCTCCCTGCC
TCTTGCTCCTTCTTCAGCTTGTCCCTCCCCTCCCCGACGCCCTTCTCCTT
CTCCTCCTTATCTTCCTCTTCCACAATTACTTGCCCTTTCTTCTCCTACC
CCTTCTCCTCCCTATCTCCCTATTCCTCCATCCTCTTCCCCTCCTCCTTT
CCTTCATTTCCCTCTTTTTTCACATTTCCCTCCTGTCCTTCCTTTCCCTT
CTCCTCCTTGGCTCCCTCCTTTTCCTCTCCCCTTTTTCCTCCTCCTGCCC
GCCTCCCTCTCTCTCCCCCCTTTTCCATCCTCTTCTCTGCCTCTCTCCTT
CTCGCCTCTTTCCCTTCCCCTCCTTGGCTCCCTCCTCGTGTCTCTCGTCC
TCGCCTCCTCCTCTTTCGATAGAGGAGGACAGTCTCCATCTTTCCCTCGA
TCCTTCTCGTCCTTTCTCCTCTTCTCCCTCTTTTCCTCTCTCTTACCCTT
CTTTCCCCCTTTATCCCTTCCTCCTTTGCACGCTCCTTCATTTCTTGCGA
TTGATTCCGTGAAGTCTCCTCCTTCCCCTCTATCCTTCCCATTCTTCCTC
CTCTCCTCCCTCTTTTCCTCCCTCTTTCCTTTTCTCCCTTTCCTCCCTTC
TTCCCTCGATCCTTCTCTTTGTTCTTTTGCACGCAATTCAACATCTTTGC
TACAGAGAAGCCTTCATGCTCCTCCTCCTCTCCTCCTTCTCCTCCTTCTC
CCTGCCTTAAACTCCTTTTCTACGTCTTCCTCCCTTTCCTCTCCTCTTTC
TCCTCCTCCTCCCAGCCTCTTCTTTCTCTATGTCCACCACTGCCATTGAT
TTTTTGGCAAATTCTCAAAACGTCATCGGCGTACTCAGATGTGCACAGCC
GCTCAATCGTCTCATCTGTCAACCCACCCAGGTCATCGTCGTCCTCTTCC
TCCACTCTTCCGCCCCGAGTCTCC back to top
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