jgi.p|Nanoce1779_2|575838, mRNA_9 (mRNA) Nannochloropsis oceanica | NanDeSyn: Nannochloropsis Design & Synthesis Initiative

Overview


Name	jgi.p\|Nanoce1779_2\|575838
Unique Name	mRNA_9
Type	mRNA
Organism	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)
Sequence length	3131
Alignment location	scaffold_3:20890..27671 +

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Properties


Property Name	Value
TranscriptId	575924
Track	FilteredModels2
ProteinId	575838

Mutants

Expression

No biomaterial libraries express this feature.

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_3	supercontig	scaffold_3:20890..27671 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gene prediction for N. oceanica CCMP1779	2008-02-01

Annotated Terms

Homology

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
jgi.p\|Nanoce1779_2\|575838	gene_9	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
jgi.p\|Nanoce1779_2\|575838	mRNA_9-protein	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	polypeptide

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
CDS_9	CDS_9	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	CDS

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
protein sequence
mRNA from alignment at scaffold_3:20890..27671+
coding sequence from alignment at scaffold_3:20890..27671+

mRNA sequence

>mRNA_9 ID=mRNA_9|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|575838|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=3131bp
CAACCACCAACCCTTCATGTCCCAGCACCAGCATCAGCACCAGCACCAGC
ACCCACACCCGCACGGGGCCACGCCACCCTGCGGAGAAGGAGGGGGTGGG
GGAGGGACGGCAAGTGGGAAAATGAGCCGGGCTGATTCCCTCGCGAATTA
TCTTGAGTTCCAGGACAGGCACAACCAGTGTGAGGTGTGCGTTCACATGG
GCAACGTTGGCAACGGCAATGGACACACCCACCATCCCTCCTTCTCTCCC
TCCCTCCAGATCATCAACAGCATGCCCTCGGAGCTCCGCCAGATCGTCAA
GCACACTTCCTCCGACTTCTCCGGTGGCTGCTTCGTCCCCGAACGAGCGG
ACGACCGCCCTTCCCTCCTCCTCTTCTGGCACTGGCTCGTGTCCCACGGG
CGGATGACGGCTCTCCTTGTCCTGATTGGAATCATCGTGTCCACTGGAGA
GCACGTCATGAACCTTGGCACCGACGGGCTGTGGCAAGGCCGACGGAGCC
TGTTGGATCTCCTTCTCCCTCCCGACACAGACTCCCGCACCTCCTGGCAG
CACAGCTCGGACGCGGGCTGGGGCTATGCTTTCCTCGTCTCCCTGGCCTT
TACTTCGACTTTGGCACTGTTGGCGGTCTTCATCTGCTCCCTCATTGACC
CCACCACCGACTGCGCGGGGAGCGGGCTGCCTTTGATCAAGTACATCCTC
TCAGGGGAGGTGATGGAGGAAGCGGAGGAGCATCTGCGGACCCGCACCCT
ATGGGCCAAGGCGCTCGGGCTGGTGCTGGCGGCAGGGGCCGGGCTGTCCA
TCGGCCGCGAGGGCCCGAACGTGCACATGGCAGCCATCATGTCCTGGCTG
CTGATGAAGAAAGTCGGGTGGTTCCATGAGATATTCCGCTTCCCTTCCCT
GCGAAGACAGATTCTCGACGCTGCCTGTGCCGTGGGTGTGTCGAGCACAT
TCGCCTCGCCCATCGGCGGCGTCTTGTTCTCTATCGAGGTCACGACCAAC
TACTACGAGATCTCCAACTACTGGAAAAGCTTTATGGCTGCCGTGGCAGG
CTTTGCCATGACACGGCTAATCTCATTCCTCCGCCGCCTCCCTGCCTACC
CCCTGGGCGAGCTCGGGCGAGCCGAGGAAGAGATGGAGGGGAAGCTCCTC
AGCGCCGCCTCCCTCCCCCTCTTCATTCTCGTTGGCGTGGTGATGGGGCT
CGTCGGACCCGCCTACACCAAAGTCAAGAGCTGGCTGTGGGGGCGTTTCA
CCCCCATCAACGCCAACCCCCGACGCCGCTACTTTCTGGCTGCCGCCGTC
TCCCTCCTCTCCGCCTCCCTCTTCTTCCTCCCGGGTCCTTTCTACCGACT
GTCCCTCGGGGAGACCACGGAGAGGCTGCTCTCGCCCAAGACCATCTACC
ACTCCGGCGCTCTTCCCACCGCTGATTCGACCCCCGCCGATGGCAATGGT
GACAGTGAAGTCGCTCTCCTCATCTACCTCGTCCTCATCCGCTTCCTCAC
CAGTGTCCTCGACACCAACCTTTACCTGCCTGCGGGTGACTTTATGTGCC
TCTTTCTTGTGGGTGCCGGCTTAGGCCGCCTGATGGGCCACGGCTTCCTG
AGAGCCTTTCCAGGGCTGGACACTCACGTCTCTTCCTTCGCGCTGTGTGG
GGCGGCGGCCCTGGCGGGGGCGTCCACGCAGACCATCAGCAGCGGCGTCA
TCGCCATCGAGCTAACTGGCGAGTACAAGCAGCAGCTTCCCATCTTCTTA
GCCGTCCTCGCCGCTTACACCATCTCCCGCGGCCTCTCCCAATCCATTTA
CGACGCGCTCACCCTGAAACGCTTTTCGCGCTACCTGCCCTCCATCCGAA
ACGACCTCTACTACAAGCTCGCTGCCGAGGACGTGATGGAGGAGGAGCTT
TACGTCGTGCCCCTCCTCACCACCTACGGCAATCTGGTGCAGCTTCTCCG
AGACCACCCTTACCGCGCCTATCCTGTCGTAACGCCCGACCAGGAGCTCC
TCGGGCTGGTGAAGCGCCGCACCCTCCTCCTCCATCTCGGCCGGGTCTTC
CGCGCGCAGGGCATTATGTTGGAGCTGACCAAGATCATGCCCCTGGACGT
GCAGCCGGTCAAGCAACCCTACCTTTCCCTTCACCACCCCACCAATGTCA
CTTCCCTGTCCACGCTCCCTCTCGGCAGCCACAGCAGCAGCAACAGCAAC
AGCTATAACAGGAGGAAGGAGAAGGAGAGGGAAAAGGCGCGAATGAAGAC
CCTGCACAACTCAGGCCTGTCGCCGGAGGAAACTGCCAAGCGCCTGGAGG
CCCTCCTTGCCTCCCCAGTCGACCTGAGGAAGGCGCCCGACATTTCTGTG
GACCCGTCCGCCTTCCGGGTCTCGGAGCTCACCCCCCTCAGTGACGTGTA
CGCACTTTTTGACTTGATTCGCTGCAATCGGGTGTTTGTCGTTTCGTATG
GTACGTGCCCCCCTTCCCTCCCTCTTTGCCACCAATCGGAGCTCGGAGTC
CATAGACCCCCTCAGCGATTTGGCCGTATACTATTTCACTCAGTTCGATG
CCATTGGGTGTTTGTCGCGTCTTCACGGCCTTCGTCAGGCATGGCACATG
TCGGTCGTCCCTGCCGTATTTTAAACCCCGACGGACAACTAAACTCGCTT
CATGGCCAACCTTCTACCCTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCC
CTCCCCTTCTCCCACTTGCAGGCGTGCTGGTGGGCGTCATCAGTCGTCGT
ATCCTGATCACGAACATCACGCACCTCAACCAAGAGCCCAACCCCGGCAA
TCCCTCCCTCCTTTTTGCCATGGGCCGCTCCACCTCCTCCCTCCCCACGC
CCCCCTCTTCCTTCCGGGCACGCTCACGGCGAGGCTCCGGTGCCACCGCC
AGCCTCCGCCAACGCTCGAGGCAGAACAGCCTCTCCACCTCCGGCTCCTC
CCTTCCTACTGGCCCGTCTTCGACCTCTTCCTCCGCCTCCCCCTTCTCTG
CCCGATCCTCCTCTAATGGGAGGCTGCAGAGCTGGGTTTCGCTATCGCTT
GTTTGGGGCGGGAAAGAAGGAGGGGAAGAAGGCCAAGAACGCCCGGGAAG
ATCAGGAGGAGGAGCAGCAACAGCAGCAGCA

protein sequence of jgi.p|Nanoce1779_2|575838

>mRNA_9-protein ID=mRNA_9-protein|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|575838|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=1000bp
MSQHQHQHQHQHPHPHGATPPCGEGGGGGGTASGKMSRADSLANYLEFQD
RHNQCEVCVHMGNVGNGNGHTHHPSFSPSLQIINSMPSELRQIVKHTSSD
FSGGCFVPERADDRPSLLLFWHWLVSHGRMTALLVLIGIIVSTGEHVMNL
GTDGLWQGRRSLLDLLLPPDTDSRTSWQHSSDAGWGYAFLVSLAFTSTLA
LLAVFICSLIDPTTDCAGSGLPLIKYILSGEVMEEAEEHLRTRTLWAKAL
GLVLAAGAGLSIGREGPNVHMAAIMSWLLMKKVGWFHEIFRFPSLRRQIL
DAACAVGVSSTFASPIGGVLFSIEVTTNYYEISNYWKSFMAAVAGFAMTR
LISFLRRLPAYPLGELGRAEEEMEGKLLSAASLPLFILVGVVMGLVGPAY
TKVKSWLWGRFTPINANPRRRYFLAAAVSLLSASLFFLPGPFYRLSLGET
TERLLSPKTIYHSGALPTADSTPADGNGDSEVALLIYLVLIRFLTSVLDT
NLYLPAGDFMCLFLVGAGLGRLMGHGFLRAFPGLDTHVSSFALCGAAALA
GASTQTISSGVIAIELTGEYKQQLPIFLAVLAAYTISRGLSQSIYDALTL
KRFSRYLPSIRNDLYYKLAAEDVMEEELYVVPLLTTYGNLVQLLRDHPYR
AYPVVTPDQELLGLVKRRTLLLHLGRVFRAQGIMLELTKIMPLDVQPVKQ
PYLSLHHPTNVTSLSTLPLGSHSSSNSNSYNRRKEKEREKARMKTLHNSG
LSPEETAKRLEALLASPVDLRKAPDISVDPSAFRVSELTPLSDVYALFDL
IRCNRVFVVSYGTCPPSLPLCHQSELGVHRPPQRFGRILFHSVRCHWVFV
ASSRPSSGMAHVGRPCRILNPDGQLNSLHGQPSTLPPSFLPSFPPSPSPT
CRRAGGRHQSSYPDHEHHAPQPRAQPRQSLPPFCHGPLHLLPPHAPLFLP
GTLTARLRCHRQPPPTLEAEQPLHLRLLPSYWPVFDLFLRLPLLCPILL*

mRNA from alignment at scaffold_3:20890..27671+

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_9 ID=mRNA_9|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|575838|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=6782bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_3:20890..27671+ (Nannochloropsis oceanica)
CAACCACCAACCCTTCATGTCCCAGCACCAGCATCAGCACCAGCACCAGC
ACCCACACCCGCACGGGGCCACGCCACCCTGCGGAGAAGGAGGGGGTGGG
GGAGGGACGGCAAGTGGGAAAATGAGCCGGGCTGATTCCCTCGCGAATTA
TCTTGAGTTCCAGGACAGGCACAACCAGTGTGAGGTACGAAGGGAGGGAA
GGAGGGAGGGAGAGAGGGAAGGAGCTCAGAAGGGCAGGGGTCAGGGAAAG
TGGAGGGGAGGGATCGCATACGTCAATACCCATCCCACCACGAATATTCC
CCTCCCTCCCATCTCCCATCCCCCCCGCCTCCCTTCACCTGCACAGCCTT
ACCTACTGATACAATACTTATATCCCATAGTTACACACCACTATTAGAGG
CCGTACTTATACACCATACTTGTATCATACTTAAATACCACACATATCCC
ATAGTTACACACCACACTTAGAGGCCGTACTTATACACCATACTTGTATC
ATACTTAAATACCACACATATCCCATACTTACACACCACACTTAGAGGCC
GTACTTATACACCATACTTGTATCATACTTAAATACCACACATATCCCAT
ACTTACACACCACACTTAGAGGCCGTACTTATACACCATACTTGTATCAT
ACTTAAATACCACACATATCCCATACTTACACACCTTACTTAGAGGCCGT
ACTTATACACCATACTTGTATCATACTTAAATACCACACATATCCCATAG
TTACACACCACACTTAGAGGCCGTACTTATACACCATACTTGTATCATAC
TTAAATACCACACATATCCCATACTTACACACCACACTTAGAGGCCGTAC
TTATACACCATACTTGTATCATACTTAAATACCACACATATCCCATACTT
ACACACCACACTTAGAGGCCGTACTTATACACCATACTTGTATCATACTT
AAATACCACACATATCCCATACTTACACACCACACTTAGAGGCCGTACTT
ATACCCACTTCCACCTCTGCCTTCCCCATTCACAGGTGTGCGTTCACATG
GGCAACGTTGGCAACGGCAATGGACACACCCACCATCCCTACTTCGCGCG
CCCTCCCCGCCGGTAAGACCCCAGACCGTTGGGGAAAATGGCCGCGTGTA
GGAGTGTCCGTGTAAGCTCTCGAACACTTTTTGGGGGCACTCACCCATCC
TCCCTCCCTCCTTCTCTCCCTCCCTCCAGATCATCAACAGCATGCCCTCG
GAGCTCCGCCAGATCGTCAAGCACACTTCCTCCGACTTCTCCGGTGGCTG
CTTCGTCCCCGAACGAGGTAACCTCAACCCTCTCCCTCTCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCTTTCTCTCCCTCCTTCCCTCTCTCCCTCCTTCCCTCATTCAC
GTCTCTTACCTGCCTGCCCTTCCTCCCTCCCTCTCTCTCTTTCGTAGCGG
ACGACCGCCCTTCCCTCCTCCTCTTCTGGCACTGGCTCGTGTCCCACGGG
CGGATGACGGCTCTCCTTGTCCTGATTGGAATCATCGTGTCCACTGGAGA
GCACGTCATGAACCTTGGCACCGGTACGCCCCTCCCTCCCTCCCTCCTCC
CTCTCCCCCCTCCTCCCTCCTTTCTTCCTCTTTCTGCTCAGATGGGCTCT
GTCGTGGCTACCTCCTCCTCTCCCTCCCCCTCTTACCCACCCGCAGGCGT
GGCCTGTCTCCCGGAGCACTCCCTCTAACATGCTCCCCTCCCTCCCTCCC
TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTGTCAGACGGGCTG
TGGCAAGGCCGACGGAGCCTGTTGGATCTCCTTCTCCCTCCCGACACAGA
CTCCCGCACCTCCTGGCAGCACAGCTCGGTACGACGGGAAGGAGGGAGGT
TTGTGGGAGGGAAATGGAGTGGAAAAACCCTCGATGCACAAAGATCCCTT
CTGATCCTAAGGTCTCACTATCCTCTCCTCGCTTCCTCCCCTCCCTCCCT
GCCCCCCCCTGCCAGGACGCGGGCTGGGGCTATGCTTTCCTCGTCTCCCT
GGCCTTTACTTCGACTTTGGCACTGTTGGCGGTCTTCATCTGCTCCCTCA
TTGACCCCACCACCGACTGCGCGGGGAGCGGGCTGCCTTTGATCAAGTAC
ATCCTCTCAGGGGTAAGTGGGTCTTGCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTTCTGGCTCATGGTTTTACTTCTGTCTGTTGCTCCGTTGC
AGACTCAAAGCACCGCCCCTCTCACCTCTCTTCTTCCCTCCTTCCCTTCC
TCCCTCCTTCCCTCCTTCACTCCTTCCCTCCTTCCCACCCTCCTTCCCTC
CTTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTCCTCCACTG
CAGGAGGTGATGGAGGAAGCGGAGGAGCATCTGCGGACCCGCACCCTATG
GGCCAAGGCGCTCGGGCTGGTGCTGGCGGCAGGGGCCGGGCTGTCCATCG
GCCGCGAGGGCCCGAACGTGCACATGGCAGCCATCATGTCCTGGCTGCTG
ATGAAGAAAGTCGGGTGGTTCCATGAGGTACCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCTCTCCTGCCCGCCCTCCCGCCCCCGCTCCTGTCCTCCTTGATGACC
CACGTGCTGCGTCGTTCCCTCTCATACATATCCACATTGAATATATAATT
ATCATCATACACCACAATAGATATTCCGCTTCCCTTCCCTGCGAAGACAG
ATTCTCGACGCTGCCTGTAAGTGCTTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCC
CTCCCTCCCTCCTCCTCTCACCCTTCCTACCTCCCTCCCTCCTCCCCCCC
TCCCCACTCTAGGTGCCGTGGGTGTGTCGAGCACATTCGCCTCGCCCATC
GGCGGCGTCTTGTTCTCTATCGAGGTCACGACCAACTACTACGAGATCTC
CAACTACTGGAAAAGCTTTATGGCTGCCGTGGCAGGCTTTGCCATGACAC
GGTACGCCCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCCCCCCCCACTTTGACGACC
TTGACTGCCCCATCCATCCCTCCCTCCCCCCCGCCCTCCCTCCTTCCATC
CGCAGGCTAATCTCATTCCTCCGCCGCCTCCCTGCCTACCCCCTGGGCGA
GCTCGGGCGAGCCGAGGAAGAGATGGAGGGGAAGCTCCTCAGCGCCGCCT
CCCTCCCCCTCTTCATTCTCGTTGGCGTGGTGATGGGGCTCGTCGGACCC
GCCTACACCAAAGTCAAGGTAGGCCTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTCTTTCCCTCCATTCCTACTCCCTCCCTCCCTTTCTTCAA
CCCTCCTTCGTCCCCCCACGAATCCCCTCACCTCCCCTCCCTCCTTCCCT
CCCTCGTTCCAGAGCTGGCTGTGGGGGCGTTTCACCCCCATCAACGCCAA
CCCCCGACGCCGCTACTTTCTGGCTGCCGCCGTCTCCCTCCTCTCCGCCT
CCCTCTTCTTCCTCCCGGGTCCTTTCTACCGACTGTCCCTCGGGGAGACC
ACGGAGAGGCTGCTCTCGCCCAAGGTGGGCCCGTGAAGAGGGAGGGAGGG
AGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGCAGGCGCACAGAAGGACG
ATGCCGCCACCAGAAAGCTCAGTGTACTCATGTGCCTCCCCCTTCCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCCCCCTCCCGCAGACCATCTACCACTCCGGCGCT
CTTCCCACCGCTGATTCGACCCCCGCCGATGGCAATGGTGACAGTGAAGT
CGCTCTCCTCATCTACCTCGTCCTCATCCGCTTCCTCACCAGTGTCCTCG
GTGCGCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTT
CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTTCTCCAATCCCCAAGCTTTTCC
TCTCTGCGGTGGACTGGATGTCCCTTTGCTCGTAAACGAACCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCC
TCCCTCCTCCAGACACCAACCTTTACCTGCCTGCGGGTGACTTTATGTGC
CTCTTTCTTGTGGGTGCCGGCTTAGGCCGCCTGATGGGCCACGGCTTCCT
GAGAGCCTTTCCAGGTCAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGCCGGGCGTG
CATCTCCCTTGAGGCAACATCCTAACCCACACTCCCTCCCTCCCCCCTTC
CTTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCCGCAGGGCTGGACACTCACG
TCTCTTCCTTCGCGCTGTGTGGGGCGGCGGCCCTGGCGGGGGCGTCCACG
CAGACCATCAGCAGCGGCGTCATCGCCATCGAGCTAACTGGTAGGACGGA
GGGAGGGAGGGGGGAAGAGAGGGAATTGCCATCGCACTGACATGCACAGA
CCGACGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGGTCGATCACCG
ACGTGCGGGCCATAATAATCCTTTGTTCCTCTGCCTTCTCTTCGCCCCTC
CGATCCGATCCACCCCCCCAGGCGAGTACAAGCAGCAGCTTCCCATCTTC
TTAGCCGTCCTCGCCGCTTACACCATCTCCCGCGGCCTCTCCCAATCCAT
TTACGACGCGCTCACCCTGGTATGGATGCCTGCCCCCCTCCCTCCCTCCC
TCCCTCCCTCCCTCCCTTTCTCCCTCTCTCCCGCGTGTCTCGATCCCGCA
TTCCTGCAAAAGACTTTCTCCCCTCAAGTTTCCCTCCCTCCCTTCCTCGT
TTCCTCCCTCTCTCCCCTCCTCCTCCCCTCCCTCCCTTGGCCTTCAGAAA
CGCTTTTCGCGCTACCTGCCCTCCATCCGAAACGACCTCTACTACAAGCT
CGCTGCCGAGGACGTGATGGAGGAGGAGCTTTACGTCGTGCCCCTCCTCA
CCACCTACGGCAATGTGAGAAGCTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCTCTTGGTTTATCAATCACATTGACACT
CTCTCCCCCCCTCCCTCCCCCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTGGTTT
ACCAGTCAACATTAACCCCCCCACTCCCCACTAACCTCCCTTCCCCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCGTACAGCTGGTGCAGCTTC
TCCGAGACCACCCTTACCGCGCCTATCCTGTCGTAACGCCCGACCAGGTA
CCTTCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCTATACTTTCATCCATCCGCTCATCCT
CCCGATTCTCTCTCCCTCTTTCCCTCGCCCTCCCTCTTTCCCTTCCTCTC
TAGGAGCTCCTCGGGCTGGTGAAGCGCCGCACCCTCCTCCTCCATCTCGG
CCGGGTCTTCCGCGCGCAGGGCATTATGTTGGAGCTGACCAAGATCATGC
CCCTGGACGTGCAGCCGGTGTGTACCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCACCCTTGATTGCCGCGA
TCCTGACTCTCCCTCCCTCTCTCCCTCCTCTCTTCCCTCCCTTCCTCCCT
CCCTCCCCCAACAGGTCAAGCAACCCTACCTTTCCCTTCACCACCCCACC
AATGTCACTTCCCTGTCCACGCTCCCTCTCGGCAGCCACAGCAGCAGCAA
CAGCAACAGCTATAACAGGAGGAAGGAGAAGGAGAGGGAAAAGGCGCGAA
TGAAGACCCTGCACAACTCAGGCCTGTCGCCGGAGGAAACTGCCAAGCGC
CTGGAGGTACAGAGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGGGGGGAA
ATGCATCAATCAGACCATTCGATTTTCCCCCAAAAGCGTGCACTCACACC
ATGCGTCTCTTCCTCCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCCCCCTGCCGCAG
GCCCTCCTTGCCTCCCCAGTCGACCTGAGGAAGGCGCCCGACATTTCTGT
GGACCCGTCCGCCTTCCGGGTCTCGGAGCTCACCCCCCTCAGTGACGTGT
ACGCACTTTTTGACTTGATTCGCTGCAATCGGGTGTTTGTCGTTTCGTAT
GGTACGTGCCCCCCTTCCCTCCCTCTTTGCCACCAATCGGAGCTCGGAGT
CCATAGACCCCCTCAGCGATTTGGCCGTATACTATTTCACTCAGTTCGAT
GCCATTGGGTGTTTGTCGCGTCTTCACGGCCTTCGTCAGGCATGGCACAT
GTCGGTCGTCCCTGCCGTATTTTAAACCCCGACGGACAACTAAACTCGCT
TCATGGCCAACCTTCTACCCTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTC
CCTCCCCTTCTCCCACTTGCAGGCGTGCTGGTGGGCGTCATCAGTCGTCG
TATCCTGATCACGAACATCACGCACCTCAACCAAGAGCCCAACCCCGGCA
ATCCCTCCCTCCTTTTTGCCATGGGCCGCTCCACCTCCTCCCTCCCCACG
CCCCCCTCTTCCTTCCGGGCACGCTCACGGCGAGGCTCCGGTGCCACCGC
CAGCCTCCGCCAACGCTCGAGGCAGAACAGCCTCTCCACCTCCGGCTCCT
CCCTTCCTACTGGCCCGTCTTCGACCTCTTCCTCCGCCTCCCCCTTCTCT
GCCCGATCCTCCTCTAATGGGAGGCTGCAGAGCTGGGTTTCGCTATCGCT
TGTTTGGGGCGGGAAAGAAGGAGGGGAAGAAGGCCAAGAACGCCCGGGAA
GATCAGGAGGAGGAGCAGCAACAGCAGCAGCA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_3:20890..27671+

>mRNA_9 ID=mRNA_9|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|575838|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=60000bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_3:20890..27671+ (Nannochloropsis oceanica)
ATGTCCCAGCACCAGCATCAGCACCAGCACCAGCACCCACACCCGCACGG
GGCCACGCCACCCTGCGGAGAAGGAGGGGGTGGGGGAGGGACGGCAAGTG
GGAAAATGAGCCGGGCTGATTCCCTCGCGAATTATCTTGAGTTCCAGGAC
AGGCACAACCAGTGTGAGGTGTGCGTTCACATGGGCAACGTTGGCAACGG
CAATGGACACACCCACCATCCCTCCTTCTCTCCCTCCCTCCAGATCATCA
ACAGCATGCCCTCGGAGCTCCGCCAGATCGTCAAGCACACTTCCTCCGAC
TTCTCCGGTGGCTGCTTCGTCCCCGAACGAGCGGACGACCGCCCTTCCCT
CCTCCTCTTCTGGCACTGGCTCGTGTCCCACGGGCGGATGACGGCTCTCC
TTGTCCTGATTGGAATCATCGTGTCCACTGGAGAGCACGTCATGAACCTT
GGCACCGACGGGCTGTGGCAAGGCCGACGGAGCCTGTTGGATCTCCTTCT
CCCTCCCGACACAGACTCCCGCACCTCCTGGCAGCACAGCTCGGACGCGG
GCTGGGGCTATGCTTTCCTCGTCTCCCTGGCCTTTACTTCGACTTTGGCA
CTGTTGGCGGTCTTCATCTGCTCCCTCATTGACCCCACCACCGACTGCGC
GGGGAGCGGGCTGCCTTTGATCAAGTACATCCTCTCAGGGGAGGTGATGG
AGGAAGCGGAGGAGCATCTGCGGACCCGCACCCTATGGGCCAAGGCGCTC
GGGCTGGTGCTGGCGGCAGGGGCCGGGCTGTCCATCGGCCGCGAGGGCCC
GAACGTGCACATGGCAGCCATCATGTCCTGGCTGCTGATGAAGAAAGTCG
GGTGGTTCCATGAGATATTCCGCTTCCCTTCCCTGCGAAGACAGATTCTC
GACGCTGCCTGTGCCGTGGGTGTGTCGAGCACATTCGCCTCGCCCATCGG
CGGCGTCTTGTTCTCTATCGAGGTCACGACCAACTACTACGAGATCTCCA
ACTACTGGAAAAGCTTTATGGCTGCCGTGGCAGGCTTTGCCATGACACGG
CTAATCTCATTCCTCCGCCGCCTCCCTGCCTACCCCCTGGGCGAGCTCGG
GCGAGCCGAGGAAGAGATGGAGGGGAAGCTCCTCAGCGCCGCCTCCCTCC
CCCTCTTCATTCTCGTTGGCGTGGTGATGGGGCTCGTCGGACCCGCCTAC
ACCAAAGTCAAGAGCTGGCTGTGGGGGCGTTTCACCCCCATCAACGCCAA
CCCCCGACGCCGCTACTTTCTGGCTGCCGCCGTCTCCCTCCTCTCCGCCT
CCCTCTTCTTCCTCCCGGGTCCTTTCTACCGACTGTCCCTCGGGGAGACC
ACGGAGAGGCTGCTCTCGCCCAAGACCATCTACCACTCCGGCGCTCTTCC
CACCGCTGATTCGACCCCCGCCGATGGCAATGGTGACAGTGAAGTCGCTC
TCCTCATCTACCTCGTCCTCATCCGCTTCCTCACCAGTGTCCTCGACACC
AACCTTTACCTGCCTGCGGGTGACTTTATGTGCCTCTTTCTTGTGGGTGC
CGGCTTAGGCCGCCTGATGGGCCACGGCTTCCTGAGAGCCTTTCCAGGGC
TGGACACTCACGTCTCTTCCTTCGCGCTGTGTGGGGCGGCGGCCCTGGCG
GGGGCGTCCACGCAGACCATCAGCAGCGGCGTCATCGCCATCGAGCTAAC
TGGCGAGTACAAGCAGCAGCTTCCCATCTTCTTAGCCGTCCTCGCCGCTT
ACACCATCTCCCGCGGCCTCTCCCAATCCATTTACGACGCGCTCACCCTG
AAACGCTTTTCGCGCTACCTGCCCTCCATCCGAAACGACCTCTACTACAA
GCTCGCTGCCGAGGACGTGATGGAGGAGGAGCTTTACGTCGTGCCCCTCC
TCACCACCTACGGCAATCTGGTGCAGCTTCTCCGAGACCACCCTTACCGC
GCCTATCCTGTCGTAACGCCCGACCAGGAGCTCCTCGGGCTGGTGAAGCG
CCGCACCCTCCTCCTCCATCTCGGCCGGGTCTTCCGCGCGCAGGGCATTA
TGTTGGAGCTGACCAAGATCATGCCCCTGGACGTGCAGCCGGTCAAGCAA
CCCTACCTTTCCCTTCACCACCCCACCAATGTCACTTCCCTGTCCACGCT
CCCTCTCGGCAGCCACAGCAGCAGCAACAGCAACAGCTATAACAGGAGGA
AGGAGAAGGAGAGGGAAAAGGCGCGAATGAAGACCCTGCACAACTCAGGC
CTGTCGCCGGAGGAAACTGCCAAGCGCCTGGAGGCCCTCCTTGCCTCCCC
AGTCGACCTGAGGAAGGCGCCCGACATTTCTGTGGACCCGTCCGCCTTCC
GGGTCTCGGAGCTCACCCCCCTCAGTGACGTGTACGCACTTTTTGACTTG
ATTCGCTGCAATCGGGTGTTTGTCGTTTCGTATGGTACGTGCCCCCCTTC
CCTCCCTCTTTGCCACCAATCGGAGCTCGGAGTCCATAGACCCCCTCAGC
GATTTGGCCGTATACTATTTCACTCAGTTCGATGCCATTGGGTGTTTGTC
GCGTCTTCACGGCCTTCGTCAGGCATGGCACATGTCGGTCGTCCCTGCCG
TATTTTAAACCCCGACGGACAACTAAACTCGCTTCATGGCCAACCTTCTA
CCCTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTCCCTCCCCTTCTCCCACT
TGCAGGCGTGCTGGTGGGCGTCATCAGTCGTCGTATCCTGATCACGAACA
TCACGCACCTCAACCAAGAGCCCAACCCCGGCAATCCCTCCCTCCTTTTT
GCCATGGGCCGCTCCACCTCCTCCCTCCCCACGCCCCCCTCTTCCTTCCG
GGCACGCTCACGGCGAGGCTCCGGTGCCACCGCCAGCCTCCGCCAACGCT
CGAGGCAGAACAGCCTCTCCACCTCCGGCTCCTCCCTTCCTACTGGCCCG
TCTTCGACCTCTTCCTCCGCCTCCCCCTTCTCTGCCCGATCCTCCTCTAA
ATGTCCCAGCACCAGCATCAGCACCAGCACCAGCACCCACACCCGCACGG
GGCCACGCCACCCTGCGGAGAAGGAGGGGGTGGGGGAGGGACGGCAAGTG
GGAAAATGAGCCGGGCTGATTCCCTCGCGAATTATCTTGAGTTCCAGGAC
AGGCACAACCAGTGTGAGGTGTGCGTTCACATGGGCAACGTTGGCAACGG
CAATGGACACACCCACCATCCCTCCTTCTCTCCCTCCCTCCAGATCATCA
ACAGCATGCCCTCGGAGCTCCGCCAGATCGTCAAGCACACTTCCTCCGAC
TTCTCCGGTGGCTGCTTCGTCCCCGAACGAGCGGACGACCGCCCTTCCCT
CCTCCTCTTCTGGCACTGGCTCGTGTCCCACGGGCGGATGACGGCTCTCC
TTGTCCTGATTGGAATCATCGTGTCCACTGGAGAGCACGTCATGAACCTT
GGCACCGACGGGCTGTGGCAAGGCCGACGGAGCCTGTTGGATCTCCTTCT
CCCTCCCGACACAGACTCCCGCACCTCCTGGCAGCACAGCTCGGACGCGG
GCTGGGGCTATGCTTTCCTCGTCTCCCTGGCCTTTACTTCGACTTTGGCA
CTGTTGGCGGTCTTCATCTGCTCCCTCATTGACCCCACCACCGACTGCGC
GGGGAGCGGGCTGCCTTTGATCAAGTACATCCTCTCAGGGGAGGTGATGG
AGGAAGCGGAGGAGCATCTGCGGACCCGCACCCTATGGGCCAAGGCGCTC
GGGCTGGTGCTGGCGGCAGGGGCCGGGCTGTCCATCGGCCGCGAGGGCCC
GAACGTGCACATGGCAGCCATCATGTCCTGGCTGCTGATGAAGAAAGTCG
GGTGGTTCCATGAGATATTCCGCTTCCCTTCCCTGCGAAGACAGATTCTC
GACGCTGCCTGTGCCGTGGGTGTGTCGAGCACATTCGCCTCGCCCATCGG
CGGCGTCTTGTTCTCTATCGAGGTCACGACCAACTACTACGAGATCTCCA
ACTACTGGAAAAGCTTTATGGCTGCCGTGGCAGGCTTTGCCATGACACGG
CTAATCTCATTCCTCCGCCGCCTCCCTGCCTACCCCCTGGGCGAGCTCGG
GCGAGCCGAGGAAGAGATGGAGGGGAAGCTCCTCAGCGCCGCCTCCCTCC
CCCTCTTCATTCTCGTTGGCGTGGTGATGGGGCTCGTCGGACCCGCCTAC
ACCAAAGTCAAGAGCTGGCTGTGGGGGCGTTTCACCCCCATCAACGCCAA
CCCCCGACGCCGCTACTTTCTGGCTGCCGCCGTCTCCCTCCTCTCCGCCT
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TTGTCCTGATTGGAATCATCGTGTCCACTGGAGAGCACGTCATGAACCTT
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CCCTCTCGGCAGCCACAGCAGCAGCAACAGCAACAGCTATAACAGGAGGA
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