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Properties
Property Name | Value |
TranscriptId | 673999 |
Track | FilteredModels2 |
ProteinId | 673913 |
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_32 | supercontig | scaffold_32:215179..217167 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >mRNA_9827 ID=mRNA_9827|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|673913|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=978bp ATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCCCACTACCACCTC CTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCCTCACCG CCTCCATCGTCATGCGCACCCGTGACAACGCCCTGGGTTTCGATGTGGAG GGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGATGACCCCCCGCAGTCCTG GCGCTACACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGT CTGCTGCCCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGG GTGGCCGGCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTT ATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTT CCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCC TGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGT TCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACT ACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCC AATGAGCTCCTCCTCTGGCGCAGTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAA AACGCACCTCGTTAATGTGGAGGAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGG AGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTACGCCGCCAAATTC CACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCCGCCCTC CCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCATGAATTAATCC TTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTCCCTCCGACTAT ACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGAGGGCGG GAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGA back to topprotein sequence of jgi.p|Nanoce1779_2|673913 >mRNA_9827-protein ID=mRNA_9827-protein|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|673913|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=326bp MAAWFWVLSGFRPTTTSSSSPSSSSSSSPLFLTASIVMRTRDNALGFDVE GSAILVVENPDDPPQSWRYTQRRLPGSHKGLTWSAALFNDEEGGYLYLVG VAGTGMEAKQVLARLPLSSLSSSPPSSPPSFPSSSMEVWAQASPPSSPPS WLPLSTHLAAGSASTLVPLFPPGTLGVSECSVYYHPHLKSYLMVTLPAFA NELLLWRSPSMTGPWAKTHLVNVEEMEKEFQKMEGYHTGSKNRLFYAAKF HPELARPPACPSSRPPSRLPFPPPLKEGEHELILTYCANVLGDWPAPSDY TPRFLRVVLREGRGEGGREGGVTDA* back to topmRNA from alignment at scaffold_32:215179..217167+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_9827 ID=mRNA_9827|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|673913|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=1989bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_32:215179..217167+ (Nannochloropsis oceanica) ATGGCGTCATCTCCTTTTTTGAACCCTCTCCTGCTGTCCTTCGCGCGGCC
CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCATCTCCCCTGCCGA
CAAAACACTTTATTTGTCTCCGGATCACAGCAGGAGGGAGGAGGAGGAAG
AGGAGGAGGGAAGAGAGAGGAAGGGAAGAAGAAGATGATGACGGCCATCC
GCGGTGAGTGGCTGCTCAGCCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCC
TCCCTCCCTCCCTCTTTGAACGTATTTATCCCTTGCTATGCTCTTTTCCT
TCACATCTCTTCCCTCTCTCTCTCCCTCCCTCCCCTCCCTCCCTCCCTCC
CTCCCTCCCCTCCCTCCCCCAGCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTT
CGTCCCACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAG
CCCCCTCTTCCTCACCGCCTCCATCGTCATGCGGTACGCTGATTTGCCTC
CCCCTCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCAAGATC
ATAAGCCACGAAGATCACGCACTCACCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTCCCTCGTTCCCTCCCTCCCTCAGCACCCGTGACAACGCC
CTGGGTTTCGATGTGGAGGGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGA
TGACCCCCCGCAGGTAGGTATGTAGGTAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGCTA
GAGGGAAGGGAGGGGAGGGGAAGGGAGGGAACACAGACACAGCAGTGTAC
GAACAGCACCCCTCTCCTCCCCCCCTCCCTCCCTCCAGTCCTGGCGCTAC
ACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGTCTGCTGC
CCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGGGTGGCCG
GCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTACTCGCCCCCTCCCTCCCTCCCTCC
CTCCCTCCTTCCCTCCCTGCGGTCGCTCAAAACGCTTCCTCCCCTCCCTT
CCTCCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTT
ATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTT
CCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCC
TGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGT
TCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACT
ACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCC
AATGAGGTACGCCGTCTTCCCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCCCTCCTTCCC
TCGTCCCCTCCCCGAGTCCCCTCCCTTCCATTCGTTAATCCCTGGAGTCA
TTTTCCTCCCTCCCGCCCTCCCTCCCTCCCTCAGCTCCTCCTCTGGCGCA
GTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAAAACGCACCTCGTTAATGTGGAG
GAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGGAGGTGAGGGAGGAAGGGAGGGA
GGGAGGGAGGGAGGGAGGGAATGAACGACTTGCATTCATCACCCGGTTGC
ACGTGTCTCATCATTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC
TCCCTTCTCCCAGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTACG
CCGCCAAATTCCACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCC
CGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCA
TGAATTAATCCTTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTC
CCTCCGACTATACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGG
GGCGAGGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold_32:215179..217167+ >mRNA_9827 ID=mRNA_9827|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|673913|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=6846bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_32:215179..217167+ (Nannochloropsis oceanica) ATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCCCACTACCACCTC CTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCCTCACCG CCTCCATCGTCATGCGCACCCGTGACAACGCCCTGGGTTTCGATGTGGAG GGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGATGACCCCCCGCAGTCCTG GCGCTACACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGT CTGCTGCCCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGG GTGGCCGGCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTT ATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTT CCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCC TGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGT TCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACT ACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCC AATGAGCTCCTCCTCTGGCGCAGTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAA AACGCACCTCGTTAATGTGGAGGAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGG AGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTACGCCGCCAAATTC CACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCCGCCCTC CCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCATGAATTAATCC TTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTCCCTCCGACTAT ACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGAGGGCGG GAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGAATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTC TCTCGGGCTTTCGTCCCACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCC TCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCCTCACCGCCTCCATCGTCATGCGCACCCG TGACAACGCCCTGGGTTTCGATGTGGAGGGATCGGCGATCCTTGTTGTGG AAAACCCCGATGACCCCCCGCAGTCCTGGCGCTACACCCAGCGCCGTTTG CCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGTCTGCTGCCCTCTTTAATGATGA GGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGGGTGGCCGGCACAGGCATGGAGG CAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTTATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCT CCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTTCCTCCATGGAAGTATGGGCCCA GGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCCTGGCTCCCGCTCTCCACCCACC TCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGTTCCTCTCTTTCCTCCGGGTACG CTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACTACCACCCTCATTTGAAGTCATA CCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCCAATGAGCTCCTCCTCTGGCGCA GTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAAAACGCACCTCGTTAATGTGGAG GAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGGAGGGCTATCACACGGGCTCCAA AAACCGCCTCTTCTACGCCGCCAAATTCCACCCGGAACTCGCCCGCCCTC CCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCT CTGAAGGAGGGAGAGCATGAATTAATCCTTACTTACTGTGCAAATGTCCT GGGCGACTGGCCGGCTCCCTCCGACTATACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGG TGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGAGGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTGACGGAT GCGTGAATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCCCACTAC CACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCC TCACCGCCTCCATCGTCATGCGCACCCGTGACAACGCCCTGGGTTTCGAT GTGGAGGGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGATGACCCCCCGCA GTCCTGGCGCTACACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCA CGTGGTCTGCTGCCCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTA GTCGGGGTGGCCGGCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCT CCCTTTATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCC CCTCTTCCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCC CCCTCCTGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTAC CCTCGTTCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTG TGTACTACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCC TTTGCCAATGAGCTCCTCCTCTGGCGCAGTCCATCTATGACCGGCCCATG GGCCAAAACGCACCTCGTTAATGTGGAGGAAATGGAGAAGGAATTTCAAA AGATGGAGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTACGCCGCC AAATTCCACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCC GCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCATGAAT TAATCCTTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTCCCTCC GACTATACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGA GGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGAATGGCCGCCTGGTTCT GGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCCCACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCC TCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCCTCACCGCCTCCATCGTCATGCG CACCCGTGACAACGCCCTGGGTTTCGATGTGGAGGGATCGGCGATCCTTG TTGTGGAAAACCCCGATGACCCCCCGCAGTCCTGGCGCTACACCCAGCGC CGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGTCTGCTGCCCTCTTTAA TGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGGGTGGCCGGCACAGGCA TGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTTATCCTCCCTCTCCTCC TCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTTCCTCCATGGAAGTATG GGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCCTGGCTCCCGCTCTCCA CCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGTTCCTCTCTTTCCTCCG GGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACTACCACCCTCATTTGAA GTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCCAATGAGCTCCTCCTCT GGCGCAGTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAAAACGCACCTCGTTAAT GTGGAGGAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGGAGGGCTATCACACGGG CTCCAAAAACCGCCTCTTCTACGCCGCCAAATTCCACCCGGAACTCGCCC GCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCT CCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCATGAATTAATCCTTACTTACTGTGCAAA TGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTCCCTCCGACTATACGCCTCGTTTCCTAA GGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGAGGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTG ACGGATGCGTGAATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCC CACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCC TCTTCCTCACCGCCTCCATCGTCATGCGCACCCGTGACAACGCCCTGGGT TTCGATGTGGAGGGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGATGACCC CCCGCAGTCCTGGCGCTACACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGG GCCTCACGTGGTCTGCTGCCCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTC TATCTAGTCGGGGTGGCCGGCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGC CCGCCTCCCTTTATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCT CCTTCCCCTCTTCCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCC TCCCCCCCCTCCTGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGC CTCTACCCTCGTTCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAAT GCAGTGTGTACTACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTC CCGGCCTTTGCCAATGAGCTCCTCCTCTGGCGCAGTCCATCTATGACCGG CCCATGGGCCAAAACGCACCTCGTTAATGTGGAGGAAATGGAGAAGGAAT TTCAAAAGATGGAGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTAC GCCGCCAAATTCCACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTC CCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGC ATGAATTAATCCTTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCT CCCTCCGACTATACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAG GGGCGAGGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGAATGGCCGCCT GGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTTTCGTCCCACTACCACCTCCTCCTCCTCC CCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCAGCCCCCTCTTCCTCACCGCCTCCATCGT CATGCGCACCCGTGACAACGCCCTGGGTTTCGATGTGGAGGGATCGGCGA TCCTTGTTGTGGAAAACCCCGATGACCCCCCGCAGTCCTGGCGCTACACC CAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTCACAAGGGCCTCACGTGGTCTGCTGCCCT CTTTAATGATGAGGAGGGAGGCTACCTCTATCTAGTCGGGGTGGCCGGCA CAGGCATGGAGGCAAAGCAGGTCCTCGCCCGCCTCCCTTTATCCTCCCTC TCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCCTTCCCCTCTTCCTCCATGGA AGTATGGGCCCAGGCCTCCCCCCCTTCCTCCCCCCCCTCCTGGCTCCCGC TCTCCACCCACCTCGCCGCCGGGTCTGCCTCTACCCTCGTTCCTCTCTTT CCTCCGGGTACGCTGGGCGTCTCCGAATGCAGTGTGTACTACCACCCTCA TTTGAAGTCATACCTCATGGTCACCCTCCCGGCCTTTGCCAATGAGCTCC TCCTCTGGCGCAGTCCATCTATGACCGGCCCATGGGCCAAAACGCACCTC GTTAATGTGGAGGAAATGGAGAAGGAATTTCAAAAGATGGAGGGCTATCA CACGGGCTCCAAAAACCGCCTCTTCTACGCCGCCAAATTCCACCCGGAAC TCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCTCCCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCC TTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGGGAGAGCATGAATTAATCCTTACTTACTG TGCAAATGTCCTGGGCGACTGGCCGGCTCCCTCCGACTATACGCCTCGTT TCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGAGGGCAGGGGCGAGGGCGGGAGGGAGGGA GGGGTGACGGATGCGTGAATGGCCGCCTGGTTCTGGGTTCTCTCGGGCTT TCGTCCCACTACCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCGTCCTCCTCCTCCA GCCCCCTCTTCCTCACCGCCTCCATCGTCATGCGCACCCGTGACAACGCC CTGGGTTTCGATGTGGAGGGATCGGCGATCCTTGTTGTGGAAAACCCCGA TGACCCCCCGCAGTCCTGGCGCTACACCCAGCGCCGTTTGCCCGGCAGTC ACAAGGGCCTCACGTGGTCTGCTGCCCTCTTTAATGATGAGGAGGGAGGC TACCTCTATCTAGTCGGGGTGGCCGGCACAGGCATGGAGGCAAAGCAGGT CCTCGCCCGCCTCCCTTTATCCTCCCTCTCCTCCTCCCCTCCCTCCTCCC CTCCCTCCTTCCCCTCTTCCTCCATGGAAGTATGGGCCCAGGCCTCCCCC CCTTCCTCCCCCCCCTCCTGGCTCCCGCTCTCCACCCACCTCGCCGCCGG GTCTGCCTCTACCCTCGTTCCTCTCTTTCCTCCGGGTACGCTGGGCGTCT CCGAATGCAGTGTGTACTACCACCCTCATTTGAAGTCATACCTCATGGTC ACCCTCCCGGCCTTTGCCAATGAGCTCCTCCTCTGGCGCAGTCCATCTAT GACCGGCCCATGGGCCAAAACGCACCTCGTTAATGTGGAGGAAATGGAGA AGGAATTTCAAAAGATGGAGGGCTATCACACGGGCTCCAAAAACCGCCTC TTCTACGCCGCCAAATTCCACCCGGAACTCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCC TTCCTCCCGCCCGCCCTCCCGCCTGCCCTTCCCTCCTCCTCTGAAGGAGG GAGAGCATGAATTAATCCTTACTTACTGTGCAAATGTCCTGGGCGACTGG CCGGCTCCCTCCGACTATACGCCTCGTTTCCTAAGGGTGGTGCTGAGGGA GGGCAGGGGCGAGGGCGGGAGGGAGGGAGGGGTGACGGATGCGTGA back to top
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