Properties
| Property Name | Value |
|---|
| TranscriptId | 35762 |
| Track | FilteredModels2 |
| ProteinId | 35676 |
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_11 | supercontig | scaffold_11:394142..396492 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >mRNA_5714 ID=mRNA_5714|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|35676|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=2105bp
ACAATACATAAATCAATATCATCAGGAAGTTATTTCTTTTTTGCGGACTT
ATTAGTGCTATTGCGGGTCGGTTTCGCTATCCGTACCGCCTTGCTTCCTG
TTGCATCTCCAGTCCGTTTACTCGCTGCAGGATATGAATTCCCCGTCGTC
TCCAAACCCGTGCCCGGACAACGGCATGTATGAGGATTGAGGATCGCAGG
CAGTATGAACGGCTTCACGAGCCTCGTGAACTTGATGCAGGTGAAACAAA
GGACTTGCCGAGGGTAGGCTTTTTCGTCATCTCCTGGTGTATGCAAGCTT
GAAAATACATCTGAGTATCATCCACCAGAGAATGCGTCGACTGTGGTCGC
ACGTCCAGAAGGGCCTGTCATGTGGCTTGGGTCTCTTGTCGCTGCTGTTT
CAGATACGTCTTAATTTCCATATTTAATTGGCGCTTCTTTTCGTCTTGCG
CCTGTTGGTGCCGGGCTCCTCTGTCCACACCTCGAGCTGTCGTTAAGTGG
CGTCGCGATACGTCTGCTCAAAGGCTTCCTTCTGCAGCTTTTGTTGCTGC
ATGTCTTCTAACAGCGCAGCTCGTTTGAGACGTTGTGCTTGGAGTCGTGC
AGCCCCACCTCGTCCTTTTCGCGCCCTTCTTGAGCGTATTTCTCACTTCG
TAGTTTGTCTTGCGTGCCAGGTCGGTGCACGCCTGCGGTTTAGTTGGGTT
GATTTCCTAAATATACATCATGTAACGGCGAGAAAACTTGACTTCGAATT
AAAATTTATTTCCCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCATCTCC
TTCCTCTTCATCTTCTCCCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCTCCTTCTT
CTTGTTCGTCTTCTTGTTCGTCTTCTTTTTCCTCTTCATCCTCTTCTTCT
TCCTCTTCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTCCTCGTCTCCCTCCTCGTCCACC
TCCTTCTCGTCCACTTCCTCCTCGTCCACCTCCTCCTCCCCCTCCTTCTC
CTCCTTCCCCTCCCCCTCTTCCACCTCGTCGAAGCGCTCCTACTATGTTT
CTCTTTCCCTTCTCCCTTCTCCCTTTCCCTTGCAAGTGCTGCACGAATTC
TAGCAATGGTTGCAAGTGCTCGTGTTGCCTTTTCTCCGGGTAAAGAGAGC
AAAGTAGGGATTCCTCTCGTTCCCTCTCCTCCTCCTACTCTTACTGCTTC
GTCCGCCCCGACTCCCCCCACTCCTACCCTTCCAGGATCCCCTCCTGTAT
CCATCCTGCTATCCCTTCCCCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCTGCCTGGGCT
CGTGCTTCTGCGACTGCCACCCGTATGGTCAGCTGCGTGCCGGCGGCTGC
TGCCGCTTCCGCAGCCCGGGTTCTTTTCCCTCTTCTTCCTCCCCCTCCTC
CCTTCCCTCCTCCCACTGCCGGTGTTGGTGCTGGTGCTGATGTTGCACTG
GCTCCCGCATATTCCCTCCCTCCCACTTCCGTTCCTCCCCCAGCTTTCTT
GCCTTGGCCTCTTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CACCTTCTTCTTCTCGTCTTCCGCCGCCTCCTCCCCCTCCTTCTCGTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCCTTCCTCCTCCTCCTGCAAC
TGATCCTCCTTCTCCTCCTGCCCTTCTTGCAATTGGGGTTAGACGCTGCC
CACAATCGTCAGGTCTTTGTCGTCAGGTGCTCGGGTACATACACTGTTCT
GTAGTGCTTTTTGCACACCCGGAGCACCCTATTGACCGGAACGCTCATCT
CTTCCTTGCCTGTGTGCGAGAAAATCCCCGCTCCATACGCGATAATAGGC
TTCGCCTGCCCTGGCCCCGTCAAGCCCGCAAAAAAGCCATCCAAAACCTT
CTGCTTTCCCGCATACACCGCCATATGCGCACGCGCCCGTTTCTTTTCGC
ACCTGGCATCCCACAATCGGTGGTAATGCTGTACGATCAGCTCCCTGTGA
GCGCTACGCAAGTCGGGACAGCAGGTCTTCATCGTGGTCCTCGAAAAGGC
GGTATTGATGTCATCGAGTGAGTCCTCCCAAGAGCTAAACTTTCTCTTGC
ACTCG back to topprotein sequence of jgi.p|Nanoce1779_2|35676 >mRNA_5714-protein ID=mRNA_5714-protein|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|35676|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=507bp
MSSNSAARLRRCAWSRAAPPRPFRALLERISHFVVCLACQVGARLRFSWV
DFLNIHHVTARKLDFELKFISLLLFLLPLPLHLLPLHLLPLPLLLLPLLL
LVRLLVRLLFPLHPLLLPLLLLSLLLLVSLLVHLLLVHFLLVHLLLPLLL
LLPLPLFHLVEALLLCFSFPSPFSLSLASAARILAMVASARVAFSPGKES
KVGIPLVPSPPPTLTASSAPTPPTPTLPGSPPVSILLSLPPPPPPAAAWA
RASATATRMVSCVPAAAAASAARVLFPLLPPPPPFPPPTAGVGAGADVAL
APAYSLPPTSVPPPAFLPWPLPPPPPPPPPPPPPPSSSRLPPPPPPPSRP
PPPPPPPSSSLPPPPATDPPSPPALLAIGVRRCPQSSGLCRQVLGYIHCS
VVLFAHPEHPIDRNAHLFLACVRENPRSIRDNRLRLPWPRQARKKAIQNL
LLSRIHRHMRTRPFLFAPGIPQSVVMLYDQLPVSATQVGTAGLHRGPRKG
GIDVIE* back to topmRNA from alignment at scaffold_11:394142..396492- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >mRNA_5714 ID=mRNA_5714|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|35676|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=2351bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_11:394142..396492- (Nannochloropsis oceanica)
ACAATACATAAATCAATATCATCAGGAAGTTATTTCTTTTTTGCGGACTT
ATTAGTGCTATTGCGGGTCGGTTTCGCTATCCGTACCGCCTTGCTTCCTG
TTGCATCTCCAGTCCGTTTACTCGCTGCAGGATATGAATTCCCCGTCGTC
TCCAAACCCGTGCCCGGACAACGGCATGTATGAGGATTGAGGATCGCAGG
CAGTATGAACGGCTTCACGAGCCTCGTGAACTTGATGCAGGTGAAACAAA
GGACTTGCCGAGGGTAGGCTTTTTCGTCATCTCCTGGTGTATGCAAGCTT
GAAAATACATCTGAGTATCATCCACCAGAGAATGCGTCGACTGTGGTCGC
ACGTCCAGAAGGGCCTGTCATGTGGCTTGGGTCTCTTGTCGCTGCTGTTT
CAGATACGTCTTAATTTCCATATTTAATTGGCGCTTCTTTTCGTCTTGCG
CCTGTTGGTGCCGGGCTCCTCTGTCCACACCTCGAGCTGTCGTTAAGTGG
CGTCGCGATACGTCTGCTCAAAGGCTTCCTTCTGCAGCTTTTGTTGCTGC
ATGTCTTCTAACAGCGCAGCTCGTTTGAGACGTTGTGCTTGGAGTCGTGC
AGCCCCACCTCGTCCTTTTCGCGCCCTTCTTGAGCGTATTTCTCACTTCG
TAGTTTGTCTTGCGTGCCAGGTCGGTGCACGCCTGCGGTTTAGTTGGGTT
GATTTCCTAAATATACATCATGTAACGGCGAGAAAACTTGACTTCGAATT
AAAATTTATTTCCCTTCTCCTCCTCCCCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCC
TGCTGCTTCTCCTTCCCCTCTGCTTCCACCGCCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CCCTTCCCCTTCCACCCCCTTCTCGTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTC
ATCTCCTTCCTCTTCATCTTCTCCCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCTC
CTTCTTCTTGTTCGTCTTCTTGTTCGTCTTCTTTTTCCTCTTCATCCTCT
TCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTCCTCGTCTCCCTCCTCG
TCCACCTCCTTCTCGTCCACTTCCTCCTCGTCCACCTCCTCCTTCCCCTC
CTTCCCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCTCCTCTTCCTCCTCTT
CCTCCTCTTCCTCCCCCTCCTCCCCCTCATCCTCCCCCTCCTTCTCCTCC
TTCCCCTCCCCCTCTTCCACCTCGTCGAAGCGCTCCTACTATGTTTCTCT
TTCCCTTCTCCCTTCTCCCTTTCCCTTGCAAGTGCTGCACGAATTCTAGC
AATGGTTGCAAGTGCTCGTGTTGCCTTTTCTCCGGGTAAAGAGAGCAAAG
TAGGGATTCCTCTCGTTCCCTCTCCTCCTCCTACTCTTACTGCTTCGTCC
GCCCCGACTCCCCCCACTCCTACCCTTCCAGGATCCCCTCCTGTATCCAT
CCTGCTATCCCTTCCCCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCTGCCTGGGCTCGTG
CTTCTGCGACTGCCACCCGTATGGTCAGCTGCGTGCCGGCGGCTGCTGCC
GCTTCCGCAGCCCGGGTTCTTTTCCCTCTTCTTCCTCCCCCTCCTCCCTT
CCCTCCTCCCACTGCCGGTGTTGGTGCTGGTGCTGATGTTGCACTGGCTC
CCGCATATTCCCTCCCTCCCACTTCCGTTCCTCCCCCAGCTTTCTTGCCT
TGGCCTCTTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACC
TTCTTCTTCTCGTCTTCCGCCGCCTCCTCCCCCTCCTTCTCGTCCTCCTC
CTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCCTTCCTCCTCCTCCTGCAACTGAT
CCTCCTTCTCCTCCTGCCCTTCTTGCAATTGGGGTTAGACGCTGCCCACA
ATCGTCAGGTCTTTGTCGTCAGGTGCTCGGGTACATACACTGTTCTGTAG
TGCTTTTTGCACACCCGGAGCACCCTATTGACCGGAACGCTCATCTCTTC
CTTGCCTGTGTGCGAGAAAATCCCCGCTCCATACGCGATAATAGGCTTCG
CCTGCCCTGGCCCCGTCAAGCCCGCAAAAAAGCCATCCAAAACCTTCTGC
TTTCCCGCATACACCGCCATATGCGCACGCGCCCGTTTCTTTTCGCACCT
GGCATCCCACAATCGGTGGTAATGCTGTACGATCAGCTCCCTGTGAGCGC
TACGCAAGTCGGGACAGCAGGTCTTCATCGTGGTCCTCGAAAAGGCGGTA
TTGATGTCATCGAGTGAGTCCTCCCAAGAGCTAAACTTTCTCTTGCACTC
G back to topCoding sequence (CDS) from alignment at scaffold_11:394142..396492- >mRNA_5714 ID=mRNA_5714|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|35676|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=4563bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_11:394142..396492- (Nannochloropsis oceanica)
TCCTCCCCCTCCTTCTCCTCCTTCCCCTCCCCCTCTTCCACCTCGTCGAA
GCGCTCCTACTATGTTTCTCTTTCCCTTCTCCCTTCTCCCTTTCCCTTGC
AAGTGCTGCACGAATTCTAGCAATGGTTGCAAGTGCTCGTGTTGCCTTTT
CTCCGGGTAAAGAGAGCAAAGTAGGGATTCCTCTCGTTCCCTCTCCTCCT
CCTACTCTTACTGCTTCGTCCGCCCCGACTCCCCCCACTCCTACCCTTCC
AGGATCCCCTCCTGTATCCATCCTGCTATCCCTTCCCCCTCCTCCTCCTC
CTGCAGCTGCCTGGGCTCGTGCTTCTGCGACTGCCACCCGTATGGTCAGC
TGCGTGCCGGCGGCTGCTGCCGCTTCCGCAGCCCGGGTTCTTTTCCCTCT
TCTTCCTCCCCCTCCTCCCTTCCCTCCTCCCACTGCCGGTGTTGGTGCTG
GTGCTGATGTTGCACTGGCTCCCGCATATTCCCTCCCTCCCACTTCCGTT
CCTCCCCCAGCTTTCTTGCCTTGGCCTCTTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCACCTTCTTCTTCTCGTCTTCCGCCGCCTCCTC
CCCCTCCTTCTCGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCCTT
CCTCCTCCTCCTGCAACTGATCCTCCTTCTCCTCCTGCCCTTCTTGCAAT
TGGGGTTAGACGCTGCCCACAATCGTCAGGTCTTTGTCGTCAGGTGCTCG
GGTACATACACTGTTCTGTAGTGCTTTTTGCACACCCGGAGCACCCTATT
GACCGGAACGCTCATCTCTTCCTTGCCTGTGTGCGAGAAAATCCCCGCTC
CATACGCGATAATAGGCTTCGCCTGCCCTGGCCCCGTCAAGCCCGCAAAA
AAGCCATCCAAAACCTTCTGCTTTCCCGCATACACCGCCATATGCGCACG
CGCCCGTTTCTTTTCGCACCTGGCATCCCACAATCGGTGGTAATGCTGTA
CGATCAGCTCCCTGTGAGCGCTACGCAAGTCGGGACAGCAGGTCTTCATC
GTGGTCCTCGAAAAGGCGGTATTGATGTCATCGAGTGACCTTCTTCTTTT
TCTTCTTCCTCTTCCTCTTCATCTCCTTCCTCTTCATCTTCTCCCTCTTC
CTCTTCTTCTTCTTCCTCTCCTTCTTCTTGTTCGTCTTCTTGTTCGTCTT
CTTTTTCCTCTTCATCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTTCTCTTCT
TCTCCTCGTCTCCCTCCTCGTCCACCTCCTTCTCGTCCACTTCCTCCTCG
TCCACCTCCATGTCTTCTAACAGCGCAGCTCGTTTGAGACGTTGTGCTTG
GAGTCGTGCAGCCCCACCTCGTCCTTTTCGCGCCCTTCTTGAGCGTATTT
CTCACTTCGTAGTTTGTCTTGCGTGCCAGGTCGGTGCACGCCTGCGGTTT
AGTTGGGTTGATTTCCTAAATATACATCATGTAACGGCGAGAAAACTTGA
CTTCGAATTAAAATTTATTTCTCCTCCCCCTCCTTCTCCTCCTTCCCCTC
CCCCTCTTCCACCTCGTCGAAGCGCTCCTACTATGTTTCTCTTTCCCTTC
TCCCTTCTCCCTTTCCCTTGCAAGTGCTGCACGAATTCTAGCAATGGTTG
CAAGTGCTCGTGTTGCCTTTTCTCCGGGTAAAGAGAGCAAAGTAGGGATT
CCTCTCGTTCCCTCTCCTCCTCCTACTCTTACTGCTTCGTCCGCCCCGAC
TCCCCCCACTCCTACCCTTCCAGGATCCCCTCCTGTATCCATCCTGCTAT
CCCTTCCCCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCTGCCTGGGCTCGTGCTTCTGCG
ACTGCCACCCGTATGGTCAGCTGCGTGCCGGCGGCTGCTGCCGCTTCCGC
AGCCCGGGTTCTTTTCCCTCTTCTTCCTCCCCCTCCTCCCTTCCCTCCTC
CCACTGCCGGTGTTGGTGCTGGTGCTGATGTTGCACTGGCTCCCGCATAT
TCCCTCCCTCCCACTTCCGTTCCTCCCCCAGCTTTCTTGCCTTGGCCTCT
TCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCTTCTTCTT
CTCGTCTTCCGCCGCCTCCTCCCCCTCCTTCTCGTCCTCCTCCTCCTCCT
CCTCCTCCTTCTTCTTCCCTTCCTCCTCCTCCTGCAACTGATCCTCCTTC
TCCTCCTGCCCTTCTTGCAATTGGGGTTAGACGCTGCCCACAATCGTCAG
GTCTTTGTCGTCAGGTGCTCGGGTACATACACTGTTCTGTAGTGCTTTTT
GCACACCCGGAGCACCCTATTGACCGGAACGCTCATCTCTTCCTTGCCTG
TGTGCGAGAAAATCCCCGCTCCATACGCGATAATAGGCTTCGCCTGCCCT
GGCCCCGTCAAGCCCGCAAAAAAGCCATCCAAAACCTTCTGCTTTCCCGC
ATACACCGCCATATGCGCACGCGCCCGTTTCTTTTCGCACCTGGCATCCC
ACAATCGGTGGTAATGCTGTACGATCAGCTCCCTGTGAGCGCTACGCAAG
TCGGGACAGCAGGTCTTCATCGTGGTCCTCGAAAAGGCGGTATTGATGTC
ATCGAGTGACCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCATCTCCTTC
CTCTTCATCTTCTCCCTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCTCCTTCTTCTT
GTTCGTCTTCTTGTTCGTCTTCTTTTTCCTCTTCATCCTCTTCTTCTTCC
TCTTCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTCCTCGTCTCCCTCCTCGTCCACCTCC
TTCTCGTCCACTTCCTCCTCGTCCACCTCCATGTCTTCTAACAGCGCAGC
TCGTTTGAGACGTTGTGCTTGGAGTCGTGCAGCCCCACCTCGTCCTTTTC
GCGCCCTTCTTGAGCGTATTTCTCACTTCGTAGTTTGTCTTGCGTGCCAG
GTCGGTGCACGCCTGCGGTTTAGTTGGGTTGATTTCCTAAATATACATCA
TGTAACGGCGAGAAAACTTGACTTCGAATTAAAATTTATTTCTCCTCCCC
CTCCTTCTCCTCCTTCCCCTCCCCCTCTTCCACCTCGTCGAAGCGCTCCT
ACTATGTTTCTCTTTCCCTTCTCCCTTCTCCCTTTCCCTTGCAAGTGCTG
CACGAATTCTAGCAATGGTTGCAAGTGCTCGTGTTGCCTTTTCTCCGGGT
AAAGAGAGCAAAGTAGGGATTCCTCTCGTTCCCTCTCCTCCTCCTACTCT
TACTGCTTCGTCCGCCCCGACTCCCCCCACTCCTACCCTTCCAGGATCCC
CTCCTGTATCCATCCTGCTATCCCTTCCCCCTCCTCCTCCTCCTGCAGCT
GCCTGGGCTCGTGCTTCTGCGACTGCCACCCGTATGGTCAGCTGCGTGCC
GGCGGCTGCTGCCGCTTCCGCAGCCCGGGTTCTTTTCCCTCTTCTTCCTC
CCCCTCCTCCCTTCCCTCCTCCCACTGCCGGTGTTGGTGCTGGTGCTGAT
GTTGCACTGGCTCCCGCATATTCCCTCCCTCCCACTTCCGTTCCTCCCCC
AGCTTTCTTGCCTTGGCCTCTTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCCTCCTCCACCTTCTTCTTCTCGTCTTCCGCCGCCTCCTCCCCCTCCT
TCTCGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCCCTTCCTCCTCC
TCCTGCAACTGATCCTCCTTCTCCTCCTGCCCTTCTTGCAATTGGGGTTA
GACGCTGCCCACAATCGTCAGGTCTTTGTCGTCAGGTGCTCGGGTACATA
CACTGTTCTGTAGTGCTTTTTGCACACCCGGAGCACCCTATTGACCGGAA
CGCTCATCTCTTCCTTGCCTGTGTGCGAGAAAATCCCCGCTCCATACGCG
ATAATAGGCTTCGCCTGCCCTGGCCCCGTCAAGCCCGCAAAAAAGCCATC
CAAAACCTTCTGCTTTCCCGCATACACCGCCATATGCGCACGCGCCCGTT
TCTTTTCGCACCTGGCATCCCACAATCGGTGGTAATGCTGTACGATCAGC
TCCCTGTGAGCGCTACGCAAGTCGGGACAGCAGGTCTTCATCGTGGTCCT
CGAAAAGGCGGTATTGATGTCATCGAGTGACCTTCTTCTTTTTCTTCTTC
CTCTTCCTCTTCATCTCCTTCCTCTTCATCTTCTCCCTCTTCCTCTTCTT
CTTCTTCCTCTCCTTCTTCTTGTTCGTCTTCTTGTTCGTCTTCTTTTTCC
TCTTCATCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTTCTCTTCTTCTCCTCG
TCTCCCTCCTCGTCCACCTCCTTCTCGTCCACTTCCTCCTCGTCCACCTC
CATGTCTTCTAACAGCGCAGCTCGTTTGAGACGTTGTGCTTGGAGTCGTG
CAGCCCCACCTCGTCCTTTTCGCGCCCTTCTTGAGCGTATTTCTCACTTC
GTAGTTTGTCTTGCGTGCCAGGTCGGTGCACGCCTGCGGTTTAGTTGGGT
TGATTTCCTAAATATACATCATGTAACGGCGAGAAAACTTGACTTCGAAT
TAAAATTTATTTC back to top
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