jgi.p|Nanoce1779_2|609680, mRNA_10091 (mRNA) Nannochloropsis oceanica | NanDeSyn: Nannochloropsis Design & Synthesis Initiative

Overview


Name	jgi.p\|Nanoce1779_2\|609680
Unique Name	mRNA_10091
Type	mRNA
Organism	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)
Sequence length	3541
Alignment location	scaffold_46:102125..109444 +

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Properties


Property Name	Value
TranscriptId	609766
Track	FilteredModels2
ProteinId	609680

Mutants

Expression

No biomaterial libraries express this feature.

Alignments

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_46	supercontig	scaffold_46:102125..109444 +

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Gene prediction for N. oceanica CCMP1779	2008-02-01

Annotated Terms

Homology

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
jgi.p\|Nanoce1779_2\|609680	gene_10091	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
jgi.p\|Nanoce1779_2\|609680	mRNA_10091-protein	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	polypeptide

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
CDS_10091	CDS_10091	Nannochloropsis oceanica (N. oceanica CCMP1779)	CDS

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
protein sequence
mRNA from alignment at scaffold_46:102125..109444+
coding sequence from alignment at scaffold_46:102125..109444+

mRNA sequence

>mRNA_10091 ID=mRNA_10091|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|609680|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=3541bp
ACAGGCCAGAAATCGTTGAGTGGTCTTGCGGGTGGTTGACTATTCGTTCG
CCCACTCCAGTCGCCTGCTTTCGTTAGTTGGAGCTCCCGCCTCTTCGCCC
AAGACCTCACGCCGGGGAGGCTGCCGGAGCAAGGCGTGTGAGGTTTAATC
AAAGTCCTCTTCGGTCTCCCGATAAAAACAAACGACAATAACAGTAACCA
GCAGCAACAGGGAGAGTGGTCTAGCCTACAATCACCCACCCTCCACGCGA
GTCGACCGCACCACATCCACATCACCCAAGACGACCATGAAGCTAGGCTC
TTCACGTGCTTCCTCCCATGCTGCCTTGGACAGCTTGGTGGGCAAGGCCG
AGCAGAAGGCCAAGGACGCCGTGACGCTGAACCGATCCTCCTCCGTCTCC
GTGGGCATCATGCCATCCAATTTGAACCGGCTTCACCAGAGCCGGCGGAC
CTACTACGAGGCCCTGCCCTTCACCACGGTGCACGGTCTCCAGTTTAAGG
AACACGTCCTCCACAAGGTTCTCTCTCACAAGTCGCTGGCCCAGGCGGCG
GACGAGGCCGGCGAGGACTCGGCCCTCCTCGCCGACGTGGATGTCGACCA
GGTGATCGTCACAGCGCCGCTGGCCTTCGCGGTCCTCATCGCCGTCATTT
CGCAATTTCTGGTCGGGTACAACACTTCCTTGATGAATGCGCCCGAGGCC
GTTGTTTTCCCCGGACACACCACAGCCGAGTGGTCACTAGCCGTCTCCGC
ATTTGCGATCGGCGGGCCCGGGGGCGCTATCATCGGCGGCATCCTGGCCA
ACAAGAAAGGACGCCGTGGGGCACTTCTCATCAATGCCTTCATCTTCCTC
TTCGGCGGCCTCGTGCTCGCCGGTGCTCCTTCCATCCTCTGGCTCATTCC
CGCCCGCTTTATCATTGGGCTGGCCTCGGGCTTCGCCTCCGTCCTCGTGC
CCATCTACCTGGGCGAGCTGGCCCCCCCCACCCTCCGAGGGACGCTCGGT
ACTCTCACGCAGTTCTCCCTCGTCATCGGCATCCTAGTCTCAGACCTGCT
GGCCTACCCCCTGGCCACCGAGAGCGGCTGGCGGGTCCTCTTTGCCGTCA
CCGCCCTCCTCACCTGCCTTCAACTCCTCTGCTCCCCCTTCCTCCTCGAG
TCGCCTCGGTGGCTGCTGGCCCGAAATGAGAAAAGCCACGAGGCCCGCGT
CATCATGAAGAAACTCCGCGGCTTCCGCGATGCCAAGGAGGTCGAGATGG
AGATCGAGCACATGATGATGGCCTCCAAGCGCGCCAAGACCCCTCACGCC
TCCGCACACAGTGCTTCGGCCCTCTACGATCTATTCCGAGACCCCTCCGT
CCGCCTCCTCCTCGTGTCCTGTTTGGTCCTGCAGATGAGCCAGCAGCTCT
GTGGCATCAATGCTGTCTTCTACTACTCCACGATGTTTTTTAACGGCATC
ATCTCCAACCCCCTAACGGGCACCATTCTCGTTGCAACCGTTAACGTCAT
TGCCACCTACGTGGCCCTAAAGCTCATGGACACTTGCGGTCGCCGCACTC
TTGTCCTGTGGTCGGCGTCAGGCATGCTCGCCTCCTGCGTCCTGGTCACT
TTGGCTCTGTATAAGATAGTGCCCAATGTGGTGGCTCTTCTGGGGGTGAT
GCTGTTCGTATTCTTTTTCGAGATCGGTCTCGGCCCCATCCCCTGGCTCA
TTGTCGCCGAAATGTTCGACCAAAAGTACGTCGCCACCGCCATGTCGGTT
TCCTGTCAGGTAAACTGGGGTTGCAATTTCATCATCGGCATCGGGTTCCC
CTTCATCAATGCCTGGCTCGGAAAGGCTTCTTTCGTCCCCTTCGGCGTGG
TGCTTACCTTGACGCTCGCCTTCACTTACATCTACCTCCCCGAGACATTG
GGACGGACGGTGCAAGAGATTCAACAGCTGGCGGCGGTGTCTGCTTCGTC
CTCCAAGGCCACTAGCATGTTAGACAAGTTCCCTGTGGCCATGAGCAAAG
GCTCTTACGGCACGAACGGAGGGAAGAAGGTCGGGAAGGAGAAAGGGAGG
GGGGGAGGGCAGAAGCAACAGGTGGTGCTTTCAGTGGATGCCCGCGACCT
GGCCATGCAGGTTTGAAGGGGTGGAGAGGGGGAGGGAGGGAATGGAGGAA
AGGAAAAGACAATGAGGCATGATGGGAAATTTTGTATGTGCTGGGATGCT
CGCGTTATTTTGAGGGCAGCGGTGAGCGAAGGGGAGGGAGGAAGAGAGTG
AGGCAGGGAGGCAAGGAGGCAGGGAGGGAGTATGTACATGAAAGGAGGGA
AGACAACAAAGAAAGTGAAGTCATAGCTAGGTGCGGCAGTAGGGGGGAGG
AGGATAAGGGGATGATGAGATGTATTTTGATGCATGATGCTCAAGTTTTT
GTGCGTTGGTATTTTCGTAGGGTTGGGAAGGATGACCCCAGAAAAAAGAA
CAAAACAGAGCGAGGCGAGAGAGCCGTCGGCGACGCAAGAAGAGTTGATG
GTGCTATGGGGCTGAACGATTGTTGCCACTCAAGAATCAGTTCGCCAGAA
CTTCATAGCTGAATTTGGGACACGAGCGTGTGTATAACCTAAGGGAATCC
TATTTTCCTGTGAGCATGTCTGGTGGTGGTGAACCGACGGGATTATACGA
TTTTATGGCTACGCGTCGCTTCTTCTGCTTCGATCAAGAAATTCAAATCT
TTCCTAGCTTCGAGAAAAACCCTAACCGAAAAGGGAGAAGACATTACTAT
TGTAGTGACGGTCAAGCTGGATGTTGTTGCGCTGTGCCGCGACGAGGACG
AGGATGAAGACGAAGACAAAGACGGCGAGTTGCTGGAATCTACATCTATA
CTGGGGCTACGGAAATTTTGGGAGTTTTTTTTAATGGCATTACAGGTCAA
TAATGCAACATCAGCTTAGTTTTCCATGAATCCTTCGAAAATACTACTGT
AGAAGTAGAGAGGGAAACATTTGGAGTGTTCTGCATCAAACGCATCCTCA
AAAGAAAGCTAGAGAAAACCAGTCGATCACCTTAAAGCAAGCAAAAAGGA
AGCAACTAAAGGAATACATGTAGCACCGTTTTCCATGATGGGTGTTATCC
ATGCTCTTCCATCTTCATTGAACGATTCCCCAGGGTCAGCACCATCAGCT
CTTCGAAGCCCCCCAGTACAAGAGCACTGCCAATTATGGTTTTTGAAGAA
ATGAGCGCAAAAACTGCGTCTCCGCAGGACTATCTGAAGCCATCTATCCA
AGATTAACCAGCTTGCTGGAGTGCAAAGCAGCCCCATTCTTTGACACTCT
TTGACACAAGTGCAAGCAAGTACAAAATGTAGAAACTTCATATGGCAACG
CGCATGCAACATGTCATGCACTCGAGACTCATCATCACAAGACCTTCAAC
GAGCCAGCAAAGAATCTCACAAAGGTATACTGTCTTATTCTTTTGCAATC
TCGTGCTGCATCTATTCCATCTCTCCCTCCCTTTTGTCATCCCTCCCGAC
AATCCTACGGGGGCCGGCGCGCGGTCAGCAATACTTCCTGT

protein sequence of jgi.p|Nanoce1779_2|609680

>mRNA_10091-protein ID=mRNA_10091-protein|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|609680|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=610bp
MKLGSSRASSHAALDSLVGKAEQKAKDAVTLNRSSSVSVGIMPSNLNRLH
QSRRTYYEALPFTTVHGLQFKEHVLHKVLSHKSLAQAADEAGEDSALLAD
VDVDQVIVTAPLAFAVLIAVISQFLVGYNTSLMNAPEAVVFPGHTTAEWS
LAVSAFAIGGPGGAIIGGILANKKGRRGALLINAFIFLFGGLVLAGAPSI
LWLIPARFIIGLASGFASVLVPIYLGELAPPTLRGTLGTLTQFSLVIGIL
VSDLLAYPLATESGWRVLFAVTALLTCLQLLCSPFLLESPRWLLARNEKS
HEARVIMKKLRGFRDAKEVEMEIEHMMMASKRAKTPHASAHSASALYDLF
RDPSVRLLLVSCLVLQMSQQLCGINAVFYYSTMFFNGIISNPLTGTILVA
TVNVIATYVALKLMDTCGRRTLVLWSASGMLASCVLVTLALYKIVPNVVA
LLGVMLFVFFFEIGLGPIPWLIVAEMFDQKYVATAMSVSCQVNWGCNFII
GIGFPFINAWLGKASFVPFGVVLTLTLAFTYIYLPETLGRTVQEIQQLAA
VSASSSKATSMLDKFPVAMSKGSYGTNGGKKVGKEKGRGGGQKQQVVLSV
DARDLAMQV*

mRNA from alignment at scaffold_46:102125..109444+

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>mRNA_10091 ID=mRNA_10091|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|609680|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=7320bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_46:102125..109444+ (Nannochloropsis oceanica)
ACAGGCCAGAAATCGTTGAGTGGTCTTGCGGGTGGTTGACTATTCGTTCG
CCCACTCCAGTCGCCTGCTTTCGTTAGTTGGAGCTCCCGCCTCTTCGCCC
AAGACCTCACGCCGGGGAGGCTGCCGGAGCAAGGCGTGTGAGGTTTAATC
AAAGTCCTCTTCGGTCTCCCGATAAAAACAAACGACAATAACAGTAACCA
GCAGCAACAGGGAGAGTGGTCTAGCCTACAATCACCCACCCTCCACGCGA
GTCGACCGCACCACATCCACATCACCCAAGGTACGTGCATGGCGTGCAAG
GCGAATATCGCGGAGATTAGACCTTTCTGCGCCGGGTGCTGCCTCTCCTC
CCTTTCCCCTCACGCGGAGGCTCGTTAACCTTTAAAGGATTGTCAGGAGC
GTTGGCTCTAATGCCTTTTGTTCTCCCTGTCTCTTTTTTCGTACACTGTA
ACGTTAATTCCTAGATGTCACACCACCAACACTGCCTCCCTTCCCACCCT
CATTCCCTCCCTCTCCACGCCCATTCCTGAACAGACGACCATGAAGCTAG
GCTCTTCACGTGCTTCCTCCCATGCTGCCTTGGACAGCTTGGTGGGCAAG
GTACGCAAAGTGGGAGGGAGGCTGGCAGGCAGGCAGGAAGGGAGAGAGGA
AGGGGAGAGAATTTCTTCGTCAGACACTGCCAATGGTCTATTTGCTTGCT
GGCATTCCCTGTCTGGCCACATGGACGCCTTCTCGTTCTCTCATATGTTC
ATATCGATGTTTCTCGCTCTTTGTCTTCGTTTCCTACTTTTGTCTCTCTA
TCTCTCCCTCCCCCCCCTCCCTCCCTCCTTCTCTCTGCCTTTCCCTAGGC
CGAGCAGAAGGCCAAGGACGCCGTGACGCTGAACCGATCCTCCTCCGTCT
CCGTGGGCATCATGCCATCCAATTTGAACCGGCTTCACCAGGTAGGGAGG
GAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGCGGAATCTGTGATGGGGAACAACTA
GAGAAGTACTTGCCTTGAACAATTCACAGCCGCTAACCTTCTCCCTCCCT
CCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTCT
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCAATCCCGCAGAGCCGGCGGACCT
ACTACGAGGCCCTGCCCTTCACCACGGTGCACGGTCTCCAGTTTAAGGTC
AGGGGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAATAAGAA
GGCGTAGTGTCCCCACATTTTTTGCCTGTGATCTTTCTGGAAACTCAGCT
TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCAGGAACACGTCCTCCACAAGGTTCTCTCTCACAAGTCGCTGGCCCA
GGCGGCGGACGAGGCCGGCGAGGACTCGGCCCTCCTCGCCGACGTGGATG
TCGACCAGGTACAACGCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCC
TTTTTTCGGCATGTTCACCTTCCCTGCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCTC
CCTCAAGGTGATCGTCACAGCGCCGCTGGCCTTCGCGGTCCTCATCGCCG
TCATTTCGCAATTTCTGGTCGGGTACAACACTTCCTTGGTGCGTCCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT
CTTTCCCTCCTTCCTTCCTTCCCTGTCTTCCTCCCAAGCCCGAGGTACTA
ACCACCCTCCCTCCCTCCCTCCCCATCTTCCTCCCTCCCTCCCGCCCTCC
CTCCCTAGATGAATGCGCCCGAGGCCGTTGTTTTCCCCGGACACACCACA
GCCGAGTGGTCACTAGCCGTCTCCGCATTTGCGATCGGTTTGTGTCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCCT
CCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCCTTTCCCTCAC
CTCACCCTCCCTCCCTCGTCCAGGCGGGCCCGGGGGCGCTATCATCGGCG
GCATCCTGGCCAACAAGAAAGGACGCCGTGGGGCACTTCTCATCAATGCC
TTCATCTTCCTCTTCGGCGGCCTCGTGCTCGCCGGTGCTCCTTCCATCCT
CTGGCTCATTCCCGCCCGCTTTATCATTGGGCTGGCCTCGGGGTAACTCC
CTCCCTTCCTCCCTCCCTCCCTTCCCTGCTTCCCTTCGCTGTCTTCTTTC
TCTAGTCTGTACAGACTTGGGGGACATTCCTCCTTTTCGCCTCACCCTCC
CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT
CAGCTTCGCCTCCGTCCTCGTGCCCATCTACCTGGGCGAGCTGGCCCCCC
CCACCCTCCGAGGGACGCTCGGTACTCTCACGCAGTTCTCCCTCGTCATC
GGCATCCTAGTCTCAGGTAAGACAGGCAGGCCGGACCTTCCCTCCCTCCC
TCCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCAACTTCTTTCCTACCCTCCTTGGA
GGCTCTTCATCTTTCGTTTTCTTTTGTTTTCATCTCCCTCTCCCCCTCCG
CCCCCCTCTCTCTGTGTCTTTCTTTTTTCCTTGCTTTGTCTCTCGCTCCC
TCTCCTCCTATCTTTCTCTCGAAATCTCGCCTCCTCCTCTCTCTCACTTT
CCCTCCCTCCCCCGCCCCCCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCTTCTCTCCCCC
TCGTCATTATCCCTCCCCCCTCCCTCCCCCCTCTCTCCCTCCCCTTCTCT
CCCCCTCGTCATTATCTCTCCCCCCTCCCTCCCCCCTCTCTCCCTCCCCT
TCTCTCCCCCTCGTCATTATCCCTCCCCCCTCCCTCCCCCCTCTCTCCCT
CCCCTTCTCTCCCCCTCGTCATTATCTCTCCCCCCTCCCTCCCCCCTCTC
TCCCTCCCCTTCTCTCCCCCTCGTCATTATCCCTCCCCCCTCCCTCCCCC
CTCTCTCCCTCCCCTTCTCTCCCCCTCGTCATTATCTCTCCCCCCTCCCT
CCCCCCTCTCTCCCTCCCCTTCTCTCCCCCTCGTCATTATCTCTCCCCCC
TCCCTCCCCCCTCTCTCCCTCCCCTTCTCTCCCCCTCGTCATTATCTCTC
CCCCCTCCCTCCCCCCTCTCTCCCCTCAGACCTGCTGGCCTACCCCCTGG
CCACCGAGAGCGGCTGGCGGGTCCTCTTTGCCGTCACCGCCCTCCTCACC
TGCCTTCAACTCCTCTGCTCCCCCTTCCTCCTCGAGTCGCCTCGGTGGCT
GCTGGCCCGAAATGAGAAAAGCCACGAGGCCCGCGTCATCATGAAGAAAC
TCCGCGGCTTCCGCGATGCCAAGGAGGTCGGTTTCTTCCCTCCCTCCCTC
CCTCCCTCCCATCAGTCGTCGGTCGTCTCATCCCCCGTCCCTCCCTCCCT
CCCTCCCTCCCTCCCTCCCCCCCTTCCTAGGTCGAGATGGAGATCGAGCA
CATGATGATGGCCTCCAAGCGCGCCAAGACCCCTCACGCCTCCGCACACA
GGCACGCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTT
CACGCCCCTTCATCTAACCAACCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCCCTACCTC
CCCACCTCCCCAGTGCTTCGGCCCTCTACGATCTATTCCGAGACCCCTCC
GTCCGCCTCCTCCTCGTGTCCTGTTTGGTCCTGCAGATGAGCCAGCAGCT
CTGTGGCATCAATGCTGTCTTCTGTAAGCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCC
TCCCTCCTTTCCTTGCTTCTTGACGACCCACACAAACGCGTACCTTTCGT
CGCCCTCCTCTGTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCATCCTCCCTG
CCTAGACTTCGGCTCCATGTTTTTCGAAACCCTCATCCCCTCTCTCCCTT
CCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCCCTTCCTTCCTAGACTACTCC
ACGATGTTTTTTAACGGCATCATCTCCAACCCCCTAACGGGCACCATTCT
CGTTGCAACCGTTAACGTCATTGCCACCTACGTGGCCCTAAAGGTACGCC
CTTCCTCCCTCCCTCCCTCGTTCCCTTCCTCCTTCCCTCCCTCCCTCTTC
TCCAACCGGCAAGAACCCTCCCCTCTCCTCGCCCCCTCTCCCCCCCCCCT
TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCCAGCTCATGGACACTTGCGGTC
GCCGCACTCTTGTCCTGTGGTCGGCGTCAGGCATGCTCGCCTCCTGCGTC
CTGGTCACTTTGGCTCTGTATAAGATAGTGCCCAATGTGGTGGCTCTTCT
GGGGGTACGTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCCTTC
CTTCCCTACCTACCTCCCTACCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC
TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTGTCTGGTGTGTGTCGGTGACGGCGGG
CGGACACAGATGACTAGACTTAAAGCTTCTTTCCCACCCGATTACTCTCC
CGGAGGCAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAGAGGAGGGATGGG
CAGGAAAAAGGTCGTGTCGGGAGGTATGCGCTTGACGAAAAAGACAATCG
GGTACGAGGTCACCAACCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTACAGGTGAT
GCTGTTCGTATTCTTTTTCGAGATCGGTCTCGGCCCCATCCCCTGGCTCA
TTGTCGCCGAAATGTTCGACCAAAAGTACGTCGCCACCGCCATGTCGGTT
TCCTGTCAGGTAGGCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCTT
CCTTCCTTCTTTTGTCGCTGTGTCTGTTTGTCTGTCTCCCTCGCGCTCCC
TCCCTCCCTCGCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC
CCTCGAGACGACAAAGTTGGCTTTCCGTCTCTCTATACCCACCCTCCCTC
CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCACAGGTAAACTGGGGTTGCAATTTCATCA
TCGGCATCGGGTTCCCCTTCATCAATGCCTGGCTCGGAAAGGTAGTGCAT
CCTCCTCGGCCCTCCCTCCTTCCCTCTCTCCTTCCCCTCAGCCCGATGCA
GCCTCCGGTCGTTTCCACCATTGCCCTCCCACGACTTTACATGCCCGCCC
TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCCCCCTTCCTCCCTCCCAACCCTCCTCCCTA
GGCTTCTTTCGTCCCCTTCGGCGTGGTGCTTACCTTGACGCTCGCCTTCA
CTTACATCTACCTCCCCGAGACATTGGGACGGACGGTGCAAGAGATTCAA
CAGCTGGCGGCGGTGTCTGCTTCGTCCTCCAAGGCCACTAGCATGTTAGG
TGAGGGAGGGAGGTGGGGGGAAGTGAGGGAGGGAAAGGAGGGAGGGAGGG
AGGCTGGGTGGAGGGAAGTGAGGGAGGGAAAGGAGGGAGGGAGGAGGGAG
AGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAAGGAGAAAAGGAGTGTGGGCAGTGATATG
CCTGATCTGTCTCTCATATGAGCTGGTGGGAAGGGATGGAGGGAGGGAGT
GTCGATGGTGCTAATTTCATCCCTCTCGCTTATCCTTCCATTCCTGCTTG
CCTCCCCCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTTTCTGTCCCGTCTCGTC
AGACAAGTTCCCTGTGGCCATGAGCAAAGGCTCTTACGGCACGAACGGAG
GGAAGAAGGTCGGGAAGGAGAAAGGGAGGGGGGGAGGGCAGAAGCAACAG
GTGGTGCTTTCAGTGGATGCCCGCGACCTGGCCATGCAGGTTTGAAGGGG
TGGAGAGGGGGAGGGAGGGAATGGAGGAAAGGAAAAGACAATGAGGCATG
ATGGGAAATTTTGTATGTGCTGGGATGCTCGCGTTATTTTGAGGGCAGCG
GTGAGCGAAGGGGAGGGAGGAAGAGAGTGAGGCAGGGAGGCAAGGAGGCA
GGGAGGGAGTATGTACATGAAAGGAGGGAAGACAACAAAGAAAGTGAAGT
CATAGCTAGGTGCGGCAGTAGGGGGGAGGAGGATAAGGGGATGATGAGAT
GTATTTTGATGCATGATGCTCAAGTTTTTGTGCGTTGGTATTTTCGTAGG
GTTGGGAAGGATGACCCCAGAAAAAAGAACAAAACAGAGCGAGGCGAGAG
AGCCGTCGGCGACGCAAGAAGAGTTGATGGTGCTATGGGGCTGAACGATT
GTTGCCACTCAAGAATCAGTTCGCCAGAACTTCATAGCTGAATTTGGGAC
ACGAGCGTGTGTATAACCTAAGGGAATCCTATTTTCCTGTGAGCATGTCT
GGTGGTGGTGAACCGACGGGATTATACGATTTTATGGCTACGCGTCGCTT
CTTCTGCTTCGATCAAGAAATTCAAATCTTTCCTAGCTTCGAGAAAAACC
CTAACCGAAAAGGGAGAAGACATTACTATTGTAGTGACGGTCAAGCTGGA
TGTTGTTGCGCTGTGCCGCGACGAGGACGAGGATGAAGACGAAGACAAAG
ACGGCGAGTTGCTGGAATCTACATCTATACTGGGGCTACGGAAATTTTGG
GAGTTTTTTTTAATGGCATTACAGGTCAATAATGCAACATCAGCTTAGTT
TTCCATGAATCCTTCGAAAATACTACTGTAGAAGTAGAGAGGGAAACATT
TGGAGTGTTCTGCATCAAACGCATCCTCAAAAGAAAGCTAGAGAAAACCA
GTCGATCACCTTAAAGCAAGCAAAAAGGAAGCAACTAAAGGAATACATGT
AGCACCGTTTTCCATGATGGGTGTTATCCATGCTCTTCCATCTTCATTGA
ACGATTCCCCAGGGTCAGCACCATCAGCTCTTCGAAGCCCCCCAGTACAA
GAGCACTGCCAATTATGGTTTTTGAAGAAATGAGCGCAAAAACTGCGTCT
CCGCAGGACTATCTGAAGCCATCTATCCAAGATTAACCAGCTTGCTGGAG
TGCAAAGCAGCCCCATTCTTTGACACTCTTTGACACAAGTGCAAGCAAGT
ACAAAATGTAGAAACTTCATATGGCAACGCGCATGCAACATGTCATGCAC
TCGAGACTCATCATCACAAGACCTTCAACGAGCCAGCAAAGAATCTCACA
AAGGTATACTGTCTTATTCTTTTGCAATCTCGTGCTGCATCTATTCCATC
TCTCCCTCCCTTTTGTCATCCCTCCCGACAATCCTACGGGGGCCGGCGCG
CGGTCAGCAATACTTCCTGT

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_46:102125..109444+

>mRNA_10091 ID=mRNA_10091|Name=jgi.p|Nanoce1779_2|609680|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=31110bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_46:102125..109444+ (Nannochloropsis oceanica)
ATGAAGCTAGGCTCTTCACGTGCTTCCTCCCATGCTGCCTTGGACAGCTT
GGTGGGCAAGGCCGAGCAGAAGGCCAAGGACGCCGTGACGCTGAACCGAT
CCTCCTCCGTCTCCGTGGGCATCATGCCATCCAATTTGAACCGGCTTCAC
CAGAGCCGGCGGACCTACTACGAGGCCCTGCCCTTCACCACGGTGCACGG
TCTCCAGTTTAAGGAACACGTCCTCCACAAGGTTCTCTCTCACAAGTCGC
TGGCCCAGGCGGCGGACGAGGCCGGCGAGGACTCGGCCCTCCTCGCCGAC
GTGGATGTCGACCAGGTGATCGTCACAGCGCCGCTGGCCTTCGCGGTCCT
CATCGCCGTCATTTCGCAATTTCTGGTCGGGTACAACACTTCCTTGATGA
ATGCGCCCGAGGCCGTTGTTTTCCCCGGACACACCACAGCCGAGTGGTCA
CTAGCCGTCTCCGCATTTGCGATCGGCGGGCCCGGGGGCGCTATCATCGG
CGGCATCCTGGCCAACAAGAAAGGACGCCGTGGGGCACTTCTCATCAATG
CCTTCATCTTCCTCTTCGGCGGCCTCGTGCTCGCCGGTGCTCCTTCCATC
CTCTGGCTCATTCCCGCCCGCTTTATCATTGGGCTGGCCTCGGGCTTCGC
CTCCGTCCTCGTGCCCATCTACCTGGGCGAGCTGGCCCCCCCCACCCTCC
GAGGGACGCTCGGTACTCTCACGCAGTTCTCCCTCGTCATCGGCATCCTA
GTCTCAGACCTGCTGGCCTACCCCCTGGCCACCGAGAGCGGCTGGCGGGT
CCTCTTTGCCGTCACCGCCCTCCTCACCTGCCTTCAACTCCTCTGCTCCC
CCTTCCTCCTCGAGTCGCCTCGGTGGCTGCTGGCCCGAAATGAGAAAAGC
CACGAGGCCCGCGTCATCATGAAGAAACTCCGCGGCTTCCGCGATGCCAA
GGAGGTCGAGATGGAGATCGAGCACATGATGATGGCCTCCAAGCGCGCCA
AGACCCCTCACGCCTCCGCACACAGTGCTTCGGCCCTCTACGATCTATTC
CGAGACCCCTCCGTCCGCCTCCTCCTCGTGTCCTGTTTGGTCCTGCAGAT
GAGCCAGCAGCTCTGTGGCATCAATGCTGTCTTCTACTACTCCACGATGT
TTTTTAACGGCATCATCTCCAACCCCCTAACGGGCACCATTCTCGTTGCA
ACCGTTAACGTCATTGCCACCTACGTGGCCCTAAAGCTCATGGACACTTG
CGGTCGCCGCACTCTTGTCCTGTGGTCGGCGTCAGGCATGCTCGCCTCCT
GCGTCCTGGTCACTTTGGCTCTGTATAAGATAGTGCCCAATGTGGTGGCT
CTTCTGGGGGTGATGCTGTTCGTATTCTTTTTCGAGATCGGTCTCGGCCC
CATCCCCTGGCTCATTGTCGCCGAAATGTTCGACCAAAAGTACGTCGCCA
CCGCCATGTCGGTTTCCTGTCAGGTAAACTGGGGTTGCAATTTCATCATC
GGCATCGGGTTCCCCTTCATCAATGCCTGGCTCGGAAAGGCTTCTTTCGT
CCCCTTCGGCGTGGTGCTTACCTTGACGCTCGCCTTCACTTACATCTACC
TCCCCGAGACATTGGGACGGACGGTGCAAGAGATTCAACAGCTGGCGGCG
GTGTCTGCTTCGTCCTCCAAGGCCACTAGCATGTTAGACAAGTTCCCTGT
GGCCATGAGCAAAGGCTCTTACGGCACGAACGGAGGGAAGAAGGTCGGGA
AGGAGAAAGGGAGGGGGGGAGGGCAGAAGCAACAGGTGGTGCTTTCAGTG
GATGCCCGCGACCTGGCCATGCAGGTTTGAATGAAGCTAGGCTCTTCACG
TGCTTCCTCCCATGCTGCCTTGGACAGCTTGGTGGGCAAGGCCGAGCAGA
AGGCCAAGGACGCCGTGACGCTGAACCGATCCTCCTCCGTCTCCGTGGGC
ATCATGCCATCCAATTTGAACCGGCTTCACCAGAGCCGGCGGACCTACTA
CGAGGCCCTGCCCTTCACCACGGTGCACGGTCTCCAGTTTAAGGAACACG
TCCTCCACAAGGTTCTCTCTCACAAGTCGCTGGCCCAGGCGGCGGACGAG
GCCGGCGAGGACTCGGCCCTCCTCGCCGACGTGGATGTCGACCAGGTGAT
CGTCACAGCGCCGCTGGCCTTCGCGGTCCTCATCGCCGTCATTTCGCAAT
TTCTGGTCGGGTACAACACTTCCTTGATGAATGCGCCCGAGGCCGTTGTT
TTCCCCGGACACACCACAGCCGAGTGGTCACTAGCCGTCTCCGCATTTGC
GATCGGCGGGCCCGGGGGCGCTATCATCGGCGGCATCCTGGCCAACAAGA
AAGGACGCCGTGGGGCACTTCTCATCAATGCCTTCATCTTCCTCTTCGGC
GGCCTCGTGCTCGCCGGTGCTCCTTCCATCCTCTGGCTCATTCCCGCCCG
CTTTATCATTGGGCTGGCCTCGGGCTTCGCCTCCGTCCTCGTGCCCATCT
ACCTGGGCGAGCTGGCCCCCCCCACCCTCCGAGGGACGCTCGGTACTCTC
ACGCAGTTCTCCCTCGTCATCGGCATCCTAGTCTCAGACCTGCTGGCCTA
CCCCCTGGCCACCGAGAGCGGCTGGCGGGTCCTCTTTGCCGTCACCGCCC
TCCTCACCTGCCTTCAACTCCTCTGCTCCCCCTTCCTCCTCGAGTCGCCT
CGGTGGCTGCTGGCCCGAAATGAGAAAAGCCACGAGGCCCGCGTCATCAT
GAAGAAACTCCGCGGCTTCCGCGATGCCAAGGAGGTCGAGATGGAGATCG
AGCACATGATGATGGCCTCCAAGCGCGCCAAGACCCCTCACGCCTCCGCA
CACAGTGCTTCGGCCCTCTACGATCTATTCCGAGACCCCTCCGTCCGCCT
CCTCCTCGTGTCCTGTTTGGTCCTGCAGATGAGCCAGCAGCTCTGTGGCA
TCAATGCTGTCTTCTACTACTCCACGATGTTTTTTAACGGCATCATCTCC
AACCCCCTAACGGGCACCATTCTCGTTGCAACCGTTAACGTCATTGCCAC
CTACGTGGCCCTAAAGCTCATGGACACTTGCGGTCGCCGCACTCTTGTCC
TGTGGTCGGCGTCAGGCATGCTCGCCTCCTGCGTCCTGGTCACTTTGGCT
CTGTATAAGATAGTGCCCAATGTGGTGGCTCTTCTGGGGGTGATGCTGTT
CGTATTCTTTTTCGAGATCGGTCTCGGCCCCATCCCCTGGCTCATTGTCG
CCGAAATGTTCGACCAAAAGTACGTCGCCACCGCCATGTCGGTTTCCTGT
CAGGTAAACTGGGGTTGCAATTTCATCATCGGCATCGGGTTCCCCTTCAT
CAATGCCTGGCTCGGAAAGGCTTCTTTCGTCCCCTTCGGCGTGGTGCTTA
CCTTGACGCTCGCCTTCACTTACATCTACCTCCCCGAGACATTGGGACGG
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CGCGGCTTCCGCGATGCCAAGGAGGTCGAGATGGAGATCGAGCACATGAT
GATGGCCTCCAAGCGCGCCAAGACCCCTCACGCCTCCGCACACAGTGCTT
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CCTCCTCCGTCTCCGTGGGCATCATGCCATCCAATTTGAACCGGCTTCAC
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CCTTCCTCCTCGAGTCGCCTCGGTGGCTGCTGGCCCGAAATGAGAAAAGC
CACGAGGCCCGCGTCATCATGAAGAAACTCCGCGGCTTCCGCGATGCCAA
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CGAGACCCCTCCGTCCGCCTCCTCCTCGTGTCCTGTTTGGTCCTGCAGAT
GAGCCAGCAGCTCTGTGGCATCAATGCTGTCTTCTACTACTCCACGATGT
TTTTTAACGGCATCATCTCCAACCCCCTAACGGGCACCATTCTCGTTGCA
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CGGTCGCCGCACTCTTGTCCTGTGGTCGGCGTCAGGCATGCTCGCCTCCT
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ACGGCACGAACGGAGGGAAGAAGGTCGGGAAGGAGAAAGGGAGGGGGGGA
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