NO30G00150.1, NO30G00150.1 (mRNA) Nannochloropsis oceanica

Overview
NameNO30G00150.1
Unique NameNO30G00150.1
TypemRNA
OrganismNannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)
Sequence length4267
Alignment locationchr30:68361..72821 -

Link to JBrowse

Properties
Mutants
Expression
No biomaterial libraries express this feature.
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
chr30genomechr30:68361..72821 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Gene prediction for N. oceanica IMET12017-10-24
Homology annotation for N. oceanica IMET12017-10-25
InterPro analysis for N. oceanica IMET12017-10-25
Annotated Terms
Homology
BLAST of NO30G00150.1 vs.
Match: WP_094023905.1 (collagen-like protein [Bacillus licheniformis])

HSP 1 Score: 763.5 bits (1970), Expect = 8.600e-217
Identity = 567/646 (87.77%), Postives = 568/646 (87.93%), Query Frame = 0
Query:  251 GPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGPTGPTGATGATGATGATGATGATGATGVTGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGA---------TGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGATGPTGATGATGPTGATGATGATGVTGATGSTGATGPMGARG 888
            GPTG TGPTG TGPTGPTG TGPTGATGPTGPTGATG TGATG TGATGATGATG TGPTGATG TGATGPTGATGATGATGATG TGATG TGATGPTGATGATGPTGATG TGATGPTGATGATGATGATGATGATG TGATG TG TGATG TGATG TGATGPTG TGATGATGATGATGATG  GATGPTG TGATGPTG TG TG TG TGATG TG TGATGATGATGATGATGPTGATGATG TG TG TGATGPTGATGATG TG TGATGATG TGATG TGATGATGPTGATG TGATGPTGATG TGATGATGATGATG TGATGPTGATGATG TGATG TGATGPTG TGATGATGATGATGATG TGATGPTG TGATG TG TG TGATGPTGATG TG TGATG TGATGATG TGPTGATGATG TGATG TGATGPTGATGATGATG TGATGA         TGATGATGPTGATGATGPTGATG TGATGPTGATGATGATGATGATG TGATG TGPTG TGATGPTGATG TG TGPTGATGATGATG TGATGATG TG TGATG TGATG TG TG TGATG TGATGATGPTGATGATGATG TGATG+TG TG  GA G
Sbjct:  187 GPTGATGPTGATGPTGPTGATGPTGATGPTGPTGATGPTGATGPTGATGATGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGATGATGATGATGPTGPTGATGATGATGATGATGPIGATGPTGPTGATGPTGPTGATGPTGATGATGPTGPTGATGATGATGATGATGPTGATGATGATGPTGPTGATGPTGATGATGPTGVTGATGATGPTGATGATGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGATGATGPTGATGPTGATGATGATGATGATGATGPTGPTGATGATGATGATGATGPTGATGPTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGPTGATGPTGATGATGPTGPTGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGATGATGATGPTGATGPTGPTGPTGATGPTGATGATGPTGPTGATGATGATGPTGATGATGPTGPTGATGPTGATGATGPTGPTGATGATGATGATGPTGATGATGATGPTGATGATGPTGATGATG 832          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of NO30G00150.1 vs.
Analysis Date: 2017-10-25 (Homology annotation for N. oceanica IMET1)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
WP_094023905.18.600e-21787.77collagen-like protein [Bacillus licheniformis][more]
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
NO30G00150NO30G00150Nannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
NO30G00150.1NO30G00150.1-proteinNannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)polypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
NO30G00150.1.cds1NO30G00150.1.cds1Nannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)CDS
NO30G00150.1.cds2NO30G00150.1.cds2Nannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)CDS
NO30G00150.1.cds3NO30G00150.1.cds3Nannochloropsis oceanica (N. oceanica IMET1)CDS


Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>NO30G00150.1 ID=NO30G00150.1|Name=NO30G00150.1|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=4267bp
TTGTCGGGTGGACCCCTAAAGATAAAAGGCCATGGCGAATAGTGCGACGC
ATCTTTTTCTTGCCAGCAGCGGCGCCCTACTTGGTTTCCTAGGACCCGCT
CCCAAAGACTACGCGTACCTGCGGCGACCATACTGCACCAACAAAATGAA
TGATATAGGGTCCAAGAAGAAGCCGGCCTTGACATGGTGCGCCTACCCTT
GTGAATTTTAACACTACAGGCAGAGGCGGTGACCTTGTCTGCGATATCCG
CCCCCCTCCCTCCCACCTTTTGCCTTGACACCAGACAAGCCGCATACACA
AGCATATTTAAATGCGTGCACATAATCATTCGCTCATTATCCTTTCACAC
CCCACGACACCTCACACCCACAGCAACCTCTTTCTCTTCAACAACCATGA
AGATGACTGCCTCCTCTATCCTCCTGGCCGGCGTTGTCCTCTTTTCCGCC
ATGTCTGCTGTCATGGTCCAAGCTCAAGTTCTAGCAAATCCTCCAGGAAT
CGACGATTGTGGCAACGTAAACCTTGAGCTCGTCCTCCTCGTTGACGTCT
CGGGTAGCATTGTCGAAGATGAGTTTAACCTTCAGAGGCAAGGGTATGTG
AATGCCTTTAACAATCCAAGTGTACAGAACAACATCGCCAGTCAACCCGA
TGGAGTAGCCGTTACATTGGTGTACTGGTCAAGTACTGATCGACAACAAC
AAGTAGTGAGGTGGACCAAGCTTACAGATGCCCAGTCGAGTGGAGAATTT
GCCGCTGCGATTAATGATGCGAGCCGTCCATTTGAAGGCGGTACAGCAAC
CTCATTTGCCATCAACTTTACAGTCAATAGTGTCTTTCCTGCAAGCGGCT
GTACCACAAACAGTAAAGTCATTGATATCTCAACAGATGGAGTACAGAAC
CAACCAGACGAGTCTGCTGAGACTAATCTGCTTTTACAAGCAGCCCGAGA
TAATGCTCAAGACCAGAATATTTCAATAAATGCGCTTGTCATCTTGGGAG
GCGGTGGAGCGGGTACTCCCATAACTGCTCAATATGCACAGGATAACATT
GTTACTTCAGGCGGCAGAGTTTTTGTGGCTTCAGGTTTTGGTGACTTTAC
ATCCGCTGTTCTAGAAAAGATTCTTTTCGAACTAGAGCCGATCCCCGGTC
CCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACA
GGTCCCACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGGGC
TACGGGTGCTACCGGGGCTACGGGTGCTACTGGTGCTACCGGGGCTACAG
GCGCCACGGGCGTTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCG
ACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGG
TGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTA
CGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGC
CCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAAC
GGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTG
CTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACC
GGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACGGGGGC
TACTGGCGCCACAGGTGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTG
GTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCC
ACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGG
CGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCA
CGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGT
GCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGTGCTACTGGCGCCAC
AGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGG
CCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACA
GGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGTGC
AACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGG
GCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCA
ACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGTGCAACGGG
GCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTA
CAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCAACAGGT
GCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTAC
GGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCG
CGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCTACT
GGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGC
TACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCG
GCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCTACTGGTGCA
ACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGG
TGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTA
CCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGT
GCTACTGGCGCCACAGGTGCCACAGGGGCTACGGGGGCTACTGGCGCCAC
AGGGCCTACCGGGGCTACTGGAGCCACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTG
CAACTGGCGCTACAGGACCCACAGGTGCAACTGGTGCAACAGGGGCTACG
GGAGTCACGGGCGCGACAGGTTCCACGGGCGCAACAGGTCCCATGGGTGC
GCGCGGGTATTCAATCTGCGAAAAGATCAAGACCAACATCAGGGCGCAAC
GCAAGAAGGTCTCCCAAAATCAGATTCTCCGAATTACAGTTAGGCTCACA
AACCGTTCAGGGGGTGATGTGGATGAAGGCAGATGGTTATTGGTGCTGCC
CGACGGAGTAACCTTTAAAGACAGCTCCATCCCCTTACAGACTGCGGGCT
CTCTTCTTGCTCTGGATCCTCTTATCGTTTATGCCAAAAAAAGCATCAAA
TTTACCATAACTATCCAGATCAGTTCCTCGGCCTCAGGTCGCCTGGTCTT
CCATACATTCCTGAATGATCCAGACACCTACTGTCAGAAGATTTCCTCGA
TAACGTTGACAGTCAAAGGAACCAAATCCAAATCCAAGAGGGCATTCTTC
AACAAGTTCCTCGCCTAAAGATATGTATATATATAAAACTATGGCGAAAC
AAAATTTGAATGAGTGGCTCCAAGCAAGAGAATGCATTCTCCTTTGCCAC
ATTCTCCCTTTGGCTATCGACACTGGAATCGCCATAGATCCTTGGGCGTG
TCAATTACACCTCCAGGGCTTGAGATCATATCCCAGCTATCCGGACATTT
TCCTCCCTCGCCTACAAGGTGCTTCAAGGTACAAGTTTTTTCGACCCTGC
CGCGTGCCCTGTATTAGTTCAGAAACGAAGAAACGTATACCTCTATCTCC
AGCACTTTATAAAGCGCTCGCAATTCTCTTTATTTTAAATCTTGTATATC
TTTACAATCTTTATAATACCGATTTCCTTGAAATTTTTGCATAGACTAAC
TTATATTATAATGAAAAAATGTACACCGTGAAATTTACGTTTTTGGCTGG
GCCTGCGCACCAAACGTGCCCCTTGAAAGTACGAATGACTACGAAGGTCT
AATAGCAGGCAAGTTCAAGTCGTATGAGCAAGCAAGACAATTAAGATTGC
TTACCATGTGCTTCAACCAAAGGGGAGGCATGGTTGTACAAGAGGGGGGT
AAAGATCGTTCCTGTCACACAAGCACCATGGAAGGGAGGGACAGGGAAGC
CCGGAAGCGCCGTGGCTAATCAAAAATGTGCGACACATCATTCGCACGGC
CGCCTGATATTGACTATCTGTACGACTAAGCCGACCACAAAACAACGGAT
CAAGAGAAATGACACACACAAGAAGGAGGTAGAGAAAATAAACAAAGGTA
CATAACAAGCCATCGAG
back to top

protein sequence of NO30G00150.1

>NO30G00150.1-protein ID=NO30G00150.1-protein|Name=NO30G00150.1|organism=Nannochloropsis oceanica|type=polypeptide|length=1024bp
MKMTASSILLAGVVLFSAMSAVMVQAQVLANPPGIDDCGNVNLELVLLVD
VSGSIVEDEFNLQRQGYVNAFNNPSVQNNIASQPDGVAVTLVYWSSTDRQ
QQVVRWTKLTDAQSSGEFAAAINDASRPFEGGTATSFAINFTVNSVFPAS
GCTTNSKVIDISTDGVQNQPDESAETNLLLQAARDNAQDQNISINALVIL
GGGGAGTPITAQYAQDNIVTSGGRVFVASGFGDFTSAVLEKILFELEPIP
GPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGPTGPTGATGATGATGATGATGA
TGATGVTGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTG
ATGATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGAT
GATGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGA
TGPTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATG
PTGATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPT
GATGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGA
TGITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATG
ITGATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGIT
GATGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGA
TGPTGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGPTGATGITGATG
PTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGATGATGATGPT
GATGATGPTGATGATGATGVTGATGSTGATGPMGARGYSICEKIKTNIRA
QRKKVSQNQILRITVRLTNRSGGDVDEGRWLLVLPDGVTFKDSSIPLQTA
GSLLALDPLIVYAKKSIKFTITIQISSSASGRLVFHTFLNDPDTYCQKIS
SITLTVKGTKSKSKRAFFNKFLA*
back to top

mRNA from alignment at chr30:68361..72821-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>NO30G00150.1 ID=NO30G00150.1|Name=NO30G00150.1|organism=Nannochloropsis oceanica|type=mRNA|length=4461bp|location=Sequence derived from alignment at chr30:68361..72821- (Nannochloropsis oceanica)
TTGTCGGGTGGACCCCTAAAGATAAAAGGCCATGGCGAATAGTGCGACGC ATCTTTTTCTTGCCAGCAGCGGCGCCCTACTTGGTTTCCTAGGACCCGCT CCCAAAGACTACGCGTACCTGCGGCGACCATACTGCACCAACAAAATGAA TGATATAGGGTCCAAGAAGAAGCCGGCCTTGACATGGTGCGCCTACCCTT GTGAATTTTAACACTACAGGCAGAGGCGGTGACCTTGTCTGCGATATCCG CCCCCCTCCCTCCCACCTTTTGCCTTGACACCAGACAAGCCGCATACACA AGCATATTTAAATGCGTGCACATAATCATTCGCTCATTATCCTTTCACAC CCCACGACACCTCACACCCACAGCAACCTCTTTCTCTTCAACAACCATGA AGATGACTGCCTCCTCTATCCTCCTGGCCGGCGTTGTCCTCTTTTCCGCC ATGGTAAGTTCCGACACGCCCATGTAAACATGCATGAATGCAAGTGCCTA TCCCATAAATCGAGCTCGCGCTCTCATTCTCTCATGTCTCCCTCCTCGTC TCTTACAGTCTGCTGTCATGGTCCAAGCTCAAGTTCTAGCAAATCCTCCA GGAATCGACGATTGTGGCAACGTAAACCTTGAGCTCGTCCTCCTCGTTGA CGTCTCGGGTAGCATTGTCGAAGATGAGTTTAACCTTCAGAGGCAAGGGT ATGTGAATGCCTTTAACAATCCAAGTGTACAGAACAACATCGCCAGTCAA CCCGATGGAGTAGCCGTTACATTGGTGTACTGGTCAAGTACTGATCGACA ACAACAAGTAGTGAGGTGGACCAAGCTTACAGATGCCCAGTCGAGTGGAG AATTTGCCGCTGCGATTAATGATGCGAGCCGTCCATTTGAAGGCGGTACA GCAACCTCATTTGCCATCAACTTTACAGTCAATAGTGTCTTTCCTGCAAG CGGCTGTACCACAAACAGTAAAGTCATTGATATCTCAACAGATGGAGTAC AGAACCAACCAGACGAGTCTGCTGAGACTAATCTGCTTTTACAAGCAGCC CGAGATAATGCTCAAGACCAGAATATTTCAATAAATGCGCTTGTCATCTT GGGAGGCGGTGGAGCGGGTACTCCCATAACTGCTCAATATGCACAGGATA ACATTGTTACTTCAGGCGGCAGAGTTTTTGTGGCTTCAGGTTTTGGTGAC TTTACATCCGCTGTTCTAGAAAAGATTCTTTTCGAACTAGAGCCGATCCC CGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTC CCACAGGTCCCACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTCCCACGGGTCCCACG GGGGCTACGGGTGCTACCGGGGCTACGGGTGCTACTGGTGCTACCGGGGC TACAGGCGCCACGGGCGTTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAG GCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCT ACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGG GGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGA CCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGT GCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTAC GGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCC CTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACG GGGGCTACTGGCGCCACAGGTGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGC TACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCG GTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCT ACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGG TCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCA CAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGTGCTACTGGC GCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCAC GGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTG CCACAGGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACA GGTGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGC CACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAG GTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGTGCA ACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGG CATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCAA CAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGG CCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTAC AGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTG CTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACG GGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGC GACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCTACTG GTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCT ACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGG CCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAA CGGGTGCTACTGGCGCCACAGGTGCCACAGGGGCTACGGGGGCTACTGGC GCCACAGGGCCTACCGGGGCTACTGGAGCCACAGGCGCGACCGGCCCTAC CGGTGCAACTGGCGCTACAGGACCCACAGGTGCAACTGGTGCAACAGGGG CTACGGGAGTCACGGGCGCGACAGGTTCCACGGGCGCAACAGGTCCCATG GGTGCGCGCGGGTATTCAATCTGCGAAAAGATCAAGACCAACATCAGGGC GCAACGCAAGAAGGTCTCCCAAAATCAGATTCTCCGAATTACAGTTAGGC TCACAAACCGTTCAGGGGGTGATGTGGATGAAGGCAGATGGTTATTGGTG CTGCCCGACGGAGTAACCTTTAAAGACAGCTCCATCCCCTTACAGACTGC GGGCTCTCTTCTTGCTCTGGATCCTCTTATCGTTTATGCCAAAAAAAGCA TCAAATTTACCATAACTATCCAGATCAGTTCCTCGGCCTCAGGTCGCCTG GTCTTCCATACATTCCTGAATGATCCAGACACCTACTGTCAGAAGATTTC CTCGATAACGGTACGTTTGGTTGGTGTTTGTTTCTCTCGATATTCAATCG AAACCTTCCATGTCTGAAGCTTTATCTTCCTTTGTCCAATCCATCTCAGT TGACAGTCAAAGGAACCAAATCCAAATCCAAGAGGGCATTCTTCAACAAG TTCCTCGCCTAAAGATATGTATATATATAAAACTATGGCGAAACAAAATT TGAATGAGTGGCTCCAAGCAAGAGAATGCATTCTCCTTTGCCACATTCTC CCTTTGGCTATCGACACTGGAATCGCCATAGATCCTTGGGCGTGTCAATT ACACCTCCAGGGCTTGAGATCATATCCCAGCTATCCGGACATTTTCCTCC CTCGCCTACAAGGTGCTTCAAGGTACAAGTTTTTTCGACCCTGCCGCGTG CCCTGTATTAGTTCAGAAACGAAGAAACGTATACCTCTATCTCCAGCACT TTATAAAGCGCTCGCAATTCTCTTTATTTTAAATCTTGTATATCTTTACA ATCTTTATAATACCGATTTCCTTGAAATTTTTGCATAGACTAACTTATAT TATAATGAAAAAATGTACACCGTGAAATTTACGTTTTTGGCTGGGCCTGC GCACCAAACGTGCCCCTTGAAAGTACGAATGACTACGAAGGTCTAATAGC AGGCAAGTTCAAGTCGTATGAGCAAGCAAGACAATTAAGATTGCTTACCA TGTGCTTCAACCAAAGGGGAGGCATGGTTGTACAAGAGGGGGGTAAAGAT CGTTCCTGTCACACAAGCACCATGGAAGGGAGGGACAGGGAAGCCCGGAA GCGCCGTGGCTAATCAAAAATGTGCGACACATCATTCGCACGGCCGCCTG ATATTGACTATCTGTACGACTAAGCCGACCACAAAACAACGGATCAAGAG AAATGACACACACAAGAAGGAGGTAGAGAAAATAAACAAAGGTACATAAC AAGCCATCGAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at chr30:68361..72821-

>NO30G00150.1 ID=NO30G00150.1|Name=NO30G00150.1|organism=Nannochloropsis oceanica|type=CDS|length=3072bp|location=Sequence derived from alignment at chr30:68361..72821- (Nannochloropsis oceanica)
ATGAAGATGACTGCCTCCTCTATCCTCCTGGCCGGCGTTGTCCTCTTTTC
CGCCATGTCTGCTGTCATGGTCCAAGCTCAAGTTCTAGCAAATCCTCCAG
GAATCGACGATTGTGGCAACGTAAACCTTGAGCTCGTCCTCCTCGTTGAC
GTCTCGGGTAGCATTGTCGAAGATGAGTTTAACCTTCAGAGGCAAGGGTA
TGTGAATGCCTTTAACAATCCAAGTGTACAGAACAACATCGCCAGTCAAC
CCGATGGAGTAGCCGTTACATTGGTGTACTGGTCAAGTACTGATCGACAA
CAACAAGTAGTGAGGTGGACCAAGCTTACAGATGCCCAGTCGAGTGGAGA
ATTTGCCGCTGCGATTAATGATGCGAGCCGTCCATTTGAAGGCGGTACAG
CAACCTCATTTGCCATCAACTTTACAGTCAATAGTGTCTTTCCTGCAAGC
GGCTGTACCACAAACAGTAAAGTCATTGATATCTCAACAGATGGAGTACA
GAACCAACCAGACGAGTCTGCTGAGACTAATCTGCTTTTACAAGCAGCCC
GAGATAATGCTCAAGACCAGAATATTTCAATAAATGCGCTTGTCATCTTG
GGAGGCGGTGGAGCGGGTACTCCCATAACTGCTCAATATGCACAGGATAA
CATTGTTACTTCAGGCGGCAGAGTTTTTGTGGCTTCAGGTTTTGGTGACT
TTACATCCGCTGTTCTAGAAAAGATTCTTTTCGAACTAGAGCCGATCCCC
GGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCCCACGGGTCC
CACAGGTCCCACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTCCCACGGGTCCCACGG
GGGCTACGGGTGCTACCGGGGCTACGGGTGCTACTGGTGCTACCGGGGCT
ACAGGCGCCACGGGCGTTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGG
CGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTA
CTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGG
GCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGAC
CGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTG
CAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACG
GGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCC
TACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACGG
GGGCTACTGGCGCCACAGGTGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCT
ACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGG
TGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTA
CTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGT
CCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCAC
AGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGTGCTACTGGCG
CCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACG
GGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGC
CACAGGTGCAACAGGGGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAG
GTGCAACGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCC
ACGGGCATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGG
TGCAACAGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGTGCAA
CGGGGCCTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGC
ATTACAGGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCAAC
AGGTGCTACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGC
CTACGGGGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACA
GGCGCGACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGC
TACTGGTGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGG
GGGCTACGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCG
ACCGGCCCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCTACTGG
TGCAACGGGGGCTACTGGCGCCACAGGCGCAACGGGGCCTACGGGGGCTA
CGGGTGCTACTGGTCCCACGGGGGCCACGGGCATTACAGGCGCGACCGGC
CCTACCGGTGCCACAGGTGCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTGCAAC
GGGTGCTACTGGCGCCACAGGTGCCACAGGGGCTACGGGGGCTACTGGCG
CCACAGGGCCTACCGGGGCTACTGGAGCCACAGGCGCGACCGGCCCTACC
GGTGCAACTGGCGCTACAGGACCCACAGGTGCAACTGGTGCAACAGGGGC
TACGGGAGTCACGGGCGCGACAGGTTCCACGGGCGCAACAGGTCCCATGG
GTGCGCGCGGGTATTCAATCTGCGAAAAGATCAAGACCAACATCAGGGCG
CAACGCAAGAAGGTCTCCCAAAATCAGATTCTCCGAATTACAGTTAGGCT
CACAAACCGTTCAGGGGGTGATGTGGATGAAGGCAGATGGTTATTGGTGC
TGCCCGACGGAGTAACCTTTAAAGACAGCTCCATCCCCTTACAGACTGCG
GGCTCTCTTCTTGCTCTGGATCCTCTTATCGTTTATGCCAAAAAAAGCAT
CAAATTTACCATAACTATCCAGATCAGTTCCTCGGCCTCAGGTCGCCTGG
TCTTCCATACATTCCTGAATGATCCAGACACCTACTGTCAGAAGATTTCC
TCGATAACGTTGACAGTCAAAGGAACCAAATCCAAATCCAAGAGGGCATT
CTTCAACAAGTTCCTCGCCTAA
back to top
Synonyms
Publications